由于市区工业的发展，污染源的增加，环境质量逐年恶化；1979年开始，先后对7个系统，71个企业单位进行了调查，开展了坑塘、地下水水质、工业污染源、大气等方面的监测工作。
坑塘水 1979年，对城内10个坑塘水质进行监测，pH超标的占70%。其中菏泽宾馆附近的坑水，含酚为国家标准的1．7倍；电影制修厂附近坑水，含铜为国家标准的1．6倍；酒厂、针织厂附近坑水内含汞为国家标准的7．3倍，含酚为国家标准的4．6倍。
地下水 1979年对几家工厂和城内几眼水井进行水质监测，均有砷、汞、锰等物质检出。双井街井水中含酚为国家标准的4．9倍，大肠杆菌超标54. 4%；酒厂井水中含细菌为国家标准的87倍；造纸厂、针织厂井水中含细菌为国家标准的793倍；制药厂、磷肥厂井水中含铬、酚超过国家标准多倍，都不宜饮用。
工业废水及河道水 1985年，菏泽市年排放工业废水量为685．43万吨，据临测，SS为2769．47吨，COD为6378. 68吨，BOD为732．08吨，石油类为1. 395吨，氨氮为1. 178吨，酚为3. 100吨,氧化物为0．206吨，氯化物为25. 369吨，硫化物为7．418吨，G+3为1. 138吨，Cv+6为0. 762吨，AS为0．002吨，Pb为0．225吨。是年，对市郊区洙赵河、红卫河、万福河进行了定点监测，河水中含有大量酚、氰化物、汞、六价铬、砷等物质；洙赵河刘庄采样
点枯水期检出酚含量是国家标准的4．38倍；万福河上游采样点枯水期有微量毒物检出，下游采样点丰水期含酚、汞均为国家标准的1．5倍，同时，还检出砷和六价铬；红卫河取样点枯水期检山酚含量为国家标准的2. 47倍，在丰水期还检出氰化物、酚、六价铬等物质。
废气 1985年对城区企业耗煤量、耗油量监测，按排放烟气标准测计，每年向大气中排放二氧化硫3687．3吨、NOX635．9吨、一氧化碳101．9吨、烟尘2075．4吨、粉尘118．5吨、碳氢化合物16. 58吨、硫化氧0. 054吨、氯化氢0．811吨、HN03雾1. 400吨、H2SO4雾2．179吨、终酸雾0．387吨、苯3．57吨等物质。1985年定点监测菏泽百货人楼里的大气，每立方米大气中含二氧化碳1．04毫克，为国家标准的11．3倍。市区降尘量每平方公里每月为57.
50吨，为国家标准的5．8倍。
土壤及农作物 郊区耕地因长期用工业废水灌溉，因而造成污染。定点监测菏泽东关十四队，每公斤土壤中含铬33克，每公斤小麦中古氰化物0．047毫克，每公斤玉米中含铬3．5毫克，每公斤西红柿中含铬0．02毫克，每公斤辣椒中含氰化物0．01毫克。
噪声 从1984年开始，市监测站采用边监测边治理的办法，监测出菏泽市固定噪声源144处，其中有30多家工厂机器噪声大，电影院、影视厅、街旁商店、维修门市部门前均按有音响设备，放音高，互相交织，声音杂乱，车辆经过市区隆隆作响，噪声严重影响了城市环境的安静。