明清时期，县衙内设公房，有典吏一名，负责管理工程建设、建筑设计、水利、交通等项事宜。
1928年（民国17年）菏泽县政府设建设科，专管城内道路、桥梁、房屋等官办建筑工程的设计、预算计划和监督施工，同时负责植树造林、水利建设等工作。
1934年，菏泽改实验县，县设建设科，负责管理工业、农业、黄河水利、民兵训练、植树造林、商业、公用房屋、公共基地、道路修筑等公共工程的投资和旅工，并负责民用建筑、私人建筑的指导和取缔。
建国后，菏泽县人民政府设建设科，负责农、林、水、交通等事宜。菏泽专署直辖菏泽县城关镇，该镇设建设股，专管城区内林业、交通、房地产、城市内各项建设的测量和设计。1954年城关镇建设股划归县建设科领导。1957年菏泽成立城市基建委员会，是地、县、镇三级政府组织的临时性指导机构，不久撤销。1959年成立菏泽县建筑工程局，与城关镇建设股并存。1962年12月建设局撤销，城内各项建设仍由城关镇建设股承担。1965年城关镇建设
股取销，恢复菏泽县城市建设局编制，1984年，菏泽市城市建设局改称菏泽市城市建设管理局，明确了职责范围，执行菏泽市《城市总体规划》。在城市建设中，从勘测设计到市政工程施工、市内交通、供水、园林绿化、环境卫生等，基本形成了较完整的规划建设和供应管理体系。