植物保护包括植物检疫、病虫测报、病虫害防治三部分内容，其总的工作方针是"预防为主，综合防治"。
常发重发病虫害 小麦病虫害 县内小麦常见病害有纹枯病、叶锈病、白粉病、全蚀病、根腐病、赤霉病、条纹叶枯病、颖枯病、土传花叶病、丛矮病、黄矮病、散黑穗病等。其中以纹枯病、叶锈病、白粉病危害最大。小麦条锈病是暴发性病害，发生突然，危害重。1960年、1963年、1964年、1966年、1973年，小麦条锈病有较大发生和流行。1986年后，由于品种改良和检疫措施得当等原因，此病已基本消退，偶有零星发生。
小麦的虫害有麦蚜、红蜘蛛、黏虫、灰飞虱、麦叶蜂、麦杆蝇、蝼蛄、金龟甲、金针虫等。其中以黏虫、红蜘蛛、麦蚜危害重。20世纪90年代后，黏虫的发生率逐渐下降，麦蚜和红蜘蛛的危害则更为突出，1996年麦田灰飞虱开始发生，并呈上升趋势。
玉米病虫害 玉米的病害有大斑病、小斑病、弯孢霉叶斑病、褐斑病、苗枯病、茎基腐病、玉米粗缩病、锈病、丝黑穗病、青枯病等。1986年－2007年间，叶斑病成为玉米常发性病害，发生面积大，危害程度严重。20世纪90年代末，玉米弯孢霉叶斑病开始发生，与大斑病、小斑病成为危害玉米叶的三大病害。1996年后，玉米粗缩病在县内开始发生，危害严重，重病地块导致80%以上的玉米减产，甚至绝产。2002年后，玉米苗枯病在县内开始发生，且危害较重。
玉米常见的虫害有玉米螟、棉铃虫、黏虫、蚜虫、蓟马、土蝗、红蜘蛛等。玉米螟一年发生三代，一代玉米螟主要危害春玉米，二、三代玉米螟主要危害夏玉米。
地瓜病虫害 地瓜病害主要有黑斑病、茎线虫病、根结线虫病、烂根病等。20世纪80年代后，黑斑病已基本得到控制，90年代仅有零星发生。1977年、1978年地瓜烂根病暴发，此病至今仍时有发生。2001年后，地瓜虫害、地瓜根结线虫病危害突出，根治难度大，在石门、店头、临沭、青云等乡镇均有虫害发生。
地瓜虫害有蛴螬、蝼蛄、金针虫、甘薯天蛾、斜纹夜蛾、卷叶蛾、土蝗、灰象甲等。蛴螬、蝼蛄、金针虫等地下害虫属于常发害虫，分布于全县，但发生程度总体维持在较低水平。甘薯天蛾和斜纹夜蛾属于暴发性害虫，1992年、1993年连续两年，县内地瓜田两种虫害发生面积均达万亩，许多田中的地瓜被其幼虫吃光。很多农民使用水桶人工捡虫，产量直接损失达8000吨。土蝗的危害，一般发生在秋季，土蝗种类以短额负蝗为主。地瓜卷叶蛾20世纪90年代发生，逐渐变成一种常发性害虫，并有逐年加重的趋势。
花生病虫害 花生病害有倒秧病（茎腐、根腐、青枯、白绢、黑霉）、叶斑病（黑斑病、褐斑病）、根结线虫病、锈病、花生疮痂病、花生网斑病等。倒秧病、叶斑病、根结线虫病为常发性病害，其中倒秧病和叶斑病，常年发病面积1.3万公顷以上，导致每年花生减产10%－30%。20世纪90年代末，花生网斑病传入，迅速蔓延。2000年后，该病与另外的两种叶斑病混合发生，对花生危害严重。花生根结线虫病，主要分布在石门、大兴、店头、临沭、青云等乡镇，面积一直在万亩左右。锈病属偶发性病害，危害不重。花生溃疡病在2000年以前曾经发现过，以后该病很少发生，但2007年该病突然暴发，蔓延到全县。
花生虫害常见的有花生蚜、红蜘蛛、地老虎、蓟马、棉铃虫、造桥虫、蛴螬、金针虫、蝼蛄等。尤其以蚜虫、蛴螬危害严重。蚜虫大发生的年份有1987年、1994年、1997年，2000年后发生相对较轻。蛴螬的危害，十分严重，每年导致花生产量损失超过20%，偏重发生的年份有2000年、2002年、2003年。以上两种虫害，经过防治，发生程度有所缓解。
大豆病虫害 常见的病害有大豆孢囊线虫、大豆病毒病等；常见的虫害有大豆造桥虫、大豆蚜虫、大豆食心虫、豆天蛾、豆荚螟、烟粉虱、地下害虫等。
蔬菜病虫害 常见的病害有霜霉病、病毒病、软腐病、灰霉病、疫病、线虫病、炭疽病、枯萎病等30余种；常见的虫害有菜蚜、菜青虫、红蜘蛛、甜菜夜蛾、蓟马、烟粉虱、美洲斑潜蝇等10余种。
病虫害监测 1976年2月，临沭县植保站成立。此后，植保站作为临沭县农业病虫害的监测机构，专职测报人员在田间调查的基础上，通过数理统计、经验预测、观察远程专家预报系统平台等方法，作出短期、中期和长期的病虫预报，并随时发布《病虫情报》，一般每年10期－20期，指导大田防治。同时，向省、市站及周边县区发送《病虫情报》，保持植保信息沟通。2004年，县植保站首次成功地开通病虫害电视预报。
病虫害防治 20世纪七八十年代，化学农药的大量使用对农作物病虫害防治，取得了良好的效果，但其弊端也日益显现：一方面使害虫抗性增加，防治效果下降；另一方面污染环境，危害人们身体健康。20世纪八九十年代，合理使用农药和综合防治病虫害，推广高效、低毒、低残留农药（菊脂类农药等），取得良好效果。在病虫害的综合防治方面，首推生物防治和物理防治。生物防治方面，1975年后推广杀螟杆菌、七二一六和赤眼蜂，用以防治玉米螟。20世纪80年代，推广井冈霉素防治小麦纹枯病，BT乳剂防治鳞翅目害虫等。2002年6月，农业部发布第199号公告，滴滴涕等剧毒、高毒农药被禁用，阿维菌素、井冈霉素、农抗120、乙蒜素、农用链霉素等生物农药在全县得以推广应用。2005年，随着省"两减三保"（减少化学农药使用量，减少化肥施用量；保产量，保品质，保环境）项目的实施，生物农药得到进一步应用。物理防治方面，包括抗病品种的选用，农作物健身栽培，黑光灯诱杀，糖醋液诱杀，温汤浸种，清洁田园，人工捕虫，冬季深耕灭虫，夏季土壤深翻曝晒，杀灭病菌等一系列措施。
植物检疫 1983年，国家《植物检疫条例》颁布。1986年，全县开展对小麦检疫对象的普查工作，重点普查小麦腥黑穗、黑森瘿蚊、毒麦、小麦全蚀病等。当年查出小麦全蚀病发生面积366.8公顷。1987年开展苹果小吉丁虫普查工作，1988年开展苹果锈病、地瓜茎线虫的普查工作。同时，开展种子苗木检疫手续的查验工作，并配合种子部门建立良种繁育基地，开展产地检疫工作。20世纪90年代，开展黄瓜黑星病、豚草、水稻象甲、美洲斑潜蝇等普查工作。1996年，在美洲斑潜蝇的普查工作中，发现被调查的2666.7公顷作物中，已有2333.3公顷查出虫害。此后该虫在全县迅速蔓延，对农作物尤其是蔬菜造成巨大危害。2005年，县植保站在朱仓、大兴、临沭镇三个乡镇发现危险性杂草银胶菊，及时进行扑灭。同年，对全县的种子经营者进行"检疫证书"的认证发放工作。2006年，申请苹果非疫区建设项目和苹果疫情阻截带监测点创建工作。其中，苹果疫情阻截带监测点工作已开始实施。