牛腿沟污水综合整治工程 牛腿沟污水集中处理及废水再利用工程是一项流域污染综合整治工程，也是《淮河流域水污染防治"十五"计划》中的重点工程。省计划委于2002年5月22日以鲁计地区〔2002〕563号文批复工程立项，同年11月4日，省计划委以鲁计重点〔2002〕1120号文批复工程初设概算，总投资6499万元，其中国债资金1750万元。随后，国家计划委将该项目列入国家"三河三湖、渤海碧海"重点水污染治理国债支持项目。整个工程于2003年4月1日开工建设，2005年10月28日完工，2006年12月9日通过验收。
牛腿沟污水集中处理及废水再利用工程 主要包括污水处理厂工程、沟体整治工程及废水再利用工程三大部分。（1）污水处理厂，为该工程核心部分，总占地面积7.51公顷，设计日处理污水能力3万吨，采取市场运作的模式，由临沂新程金锣肉制品有限公司以BOT方式投资建设运营，运营期26年。该工程2004年8月27日开工建设，2005年10月28日建成投入试运营。（2）沟体整治工程，主要是通过沟体清淤整治、护坡、修筑桥闸及两岸绿化等辅助工程的建设，使牛腿沟沟体形成蓄水氧化塘，将污水处理厂处理后的污水进一步净化，最终实现牛腿沟入新沭河水质达到国家规定的地表水水质要求。该工程包括清淤开挖沟体12.9公里，护砌岸坡8.6公里，修筑沿沟路10.2公里。（3）废水再利用工程，主要是通过建筑电灌站、穿堤涵洞和灌溉渠道，将处理后并贮存在牛腿沟内的废水最大限度的在流域内加以利用，建设桥、涵、闸、水簸箕等85座，种植树木3万余棵。
整个工程完工投入运营后，发挥了良好的社会经济环境效益，彻底解决了与江苏省石梁河水库的水污染纠纷，年消减化学需氧量1900吨。同时，处理后的废水还可用于牛腿沟两岸5333公顷农田的灌溉及回用于沿岸有关企业，促进地方经济社会环境和谐发展。
牛腿沟污水处理厂及配套污水管网工程 牛腿沟污水处理厂配套污水管网工程由省发改委于2005年年底批复立项（鲁发改投资〔2005〕1344号），是牛腿沟污水处理厂的配套工程，工程批复总投资2578万元，实际到位资金1460万元，其中国家补助资金600万元，地方自筹860万元。
主要建设内容：新建管网35620米，其中直径300毫米污水干管15084米、直径400毫米污水干管9844米、直径500毫米污水干管2378米、直径600毫米污水干管5023米、直径800毫米污水干管1820米、直径1000毫米污水干管1471米。建设地点位于县内郑山、南古两镇及经济开发区内。工程自2006年7月开工建设，2007年10月基本完工。主要管线有牛腿沟东西两岸主管线、沂蒙老区酒业有限公司至牛腿沟西岸支管线、经济开发区内金宝诚管业有限公司至牛腿沟西岸支管线，兴大支线、鑫发支线、郑山支线等。