天主教传入境内始于明末清初。清康熙三十九年(1700)在三元阁设立教堂，由方济各会士、意大利籍伊大仁主教主持。清雍正三年(1725)，教堂被清政府烧毁，教士被杀或被驱逐，教产被充公。清道光十五年(1835)前后，天主教再次传入境内，设教堂于达鼓巷。至清光绪二十六年(1900)，发展教徒五六十人，同年六月教堂被义和团烧毁。民国4年(1915)，神父王赐玺主持，于原址重修教堂，系砖瓦结构的哥特式建筑。1967年被拆除。
临清天主教会原属济南教区。民国12年(1923)三月，临清教区析出，为山东省第一个华籍教区，有教徒3万余人。教区主教、神父皆为华人，辖临清县、武城县、夏津县、邱县、聊城县、堂邑县、茌平县、博平县、清平县、莘县、高唐县、馆陶县、冠县等13县及河北省威县境内的山东属地3个十八村。
主教堂初设于小芦村，民国19年(1930)秋，若瑟小修道院于小芦村成立，民国23年(1934)迁至达鼓巷。民国24年(1935)秋又迁至南门外板井街，建有十字楼(今临清第一中学校址，楼仍存)。从民国12年(1923)临清教区析出至1967年，其间有3位主教(胡修身、李荩臣、李本良)、41名神父主持临清教区的天主教活动。
1964年区划变更后，境内教徒很少，分布在金郝庄乡戴庄村、康庄镇吕庙村、石槽乡柴庄村、张官屯村及城区，计200余人。中共十一届三中全会后，人民政府贯彻宗教信仰自由政策，恢复了金郝庄乡戴庄村和石槽乡柴庄村两处宗教活动点，教徒可集体祈祷或望撒。1984年，青年教友李树兴、吕培森考取济南圣神修道院。1985年10月，临清市天主教爱国会成立，主任李启才。
教会活动由主教统一管理。管辖教区的所有教徒及堂口，任、免、调总铎、本堂神父、修道院院长及帐房管理人员(教会会计，由神父担任)。对一些有土地收入的堂口，主教可调配收入。
临清教会建立之初，为方便管理，下设4个总铎区及主教座堂辖区：
1934年总铎区及主教座堂辖区表
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│总铎区名称│辖区 │
├─────┼─────────────────────┤
│小芦 │临清县、馆陶县、邱县、及山东属地3个十八村 │
├─────┼─────────────────────┤
│十二里庄 │武城县、夏津县 │
├─────┼─────────────────────┤
│聊城 │聊城县、堂邑县、莘县、冠县 │
├─────┼─────────────────────┤
│张庄 │高唐县、茌平县、博平县、清平县 │
├─────┼─────────────────────┤
│主教座堂 │达鼓巷、小修道院、若瑟仁爱会 │
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1934年堂口及教徒分布情况表(人数为约数)
小芦总铎区：
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│村庄名称 │有否教堂│住神父否│人数│
├───────┼────┼────┼──┤
│临清县小芦 │有 │住 │760 │
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│临清县尖冢 │有 │住 │200 │
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│临清县下堡寺 │有 │住 │80 │
├───────┼────┼────┼──┤
│临清县指挥屯 │有 │否 │50 │
├───────┼────┼────┼──┤
│临清县侯庄 │无 │否 │40 │
├───────┼────┼────┼──┤
│临清县刁庄 │无 │否 │30 │
├───────┼────┼────┼──┤
│临清县摇鞍镇 │无 │否 │30 │
├───────┼────┼────┼──┤
│临清县张三寨 │有 │否 │40 │
├───────┼────┼────┼──┤
│临清县王庄 │有 │否 │50 │
├───────┼────┼────┼──┤
│临清县指挥墓村│无 │否 │20 │
├───────┼────┼────┼──┤
│临清县姚楼 │无 │否 │20 │
├───────┼────┼────┼──┤
│临清县西大屯 │无 │否 │20 │
├───────┼────┼────┼──┤
│邱县程尔寨 │有 │住 │130 │
├───────┼────┼────┼──┤
│邱县贺堡 │有 │否 │80 │
├───────┼────┼────┼──┤
│邱县鞠辛庄 │有 │否 │40 │
├───────┼────┼────┼──┤
│邱县齐堡 │有 │否 │40 │
├───────┼────┼────┼──┤
│邱县花坦 │无 │否 │20 │
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续表
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│村庄名称 │有无教堂│住神父否│人数│
├─────────┼────┼────┼──┤
│邱县刘庄 │有 │否 │60 │
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│馆陶县郭庄 │有 │住 │250 │
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│馆陶县西河寨 │有 │住 │200 │
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│馆陶县刘庄 │有 │否 │50 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│馆陶县张庄 │无 │否 │20 │
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│馆陶县阎庄 │无 │否 │20 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│馆陶县大罗卜 │无 │否 │30 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│馆陶县常庄 │无 │否 │30 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│邱县十八村贺钊 │有 │否 │200 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│邱县十八村常屯 │有 │住 │300 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│邱县十八村郑店 │有 │否 │40 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│邱县十八村辛店 │有 │否 │50 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│邱县十八村褚庄 │有 │否 │40 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│邱县十八村杨庄 │无 │否 │30 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│邱县十八村潘庄 │有 │否 │40 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│邱县十八村马庄 │有 │否 │40 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│冠县十八村梨元屯 │有 │住 │300 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│冠县十八村杏元屯 │有 │否 │100 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│冠县十八村于集 │有 │否 │150 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│冠县十八村红桃园 │有 │否 │300 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│冠县十八村孙庄 │有 │否 │80 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│冠县十八村小李固 │有 │否 │150 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│冠县十八村柳甸 │有 │否 │60 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│冠县十八村固献 │有 │否 │40 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│冠县十八村西河口 │有 │否 │50 │
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│冠县十八村蒋庄 │有 │否 │40 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│冠县十八村枣科 │有 │否 │40 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│冠县十八村陈固 │无 │否 │30 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│临清县十八村南庄 │有 │否 │150 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│临清县十八村侯林士│无 │否 │25 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│临清县十八村中侯 │无 │否 │40 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│临清县十八村牛寨 │有 │否 │50 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│临清县十八村孟官屯│有 │否 │60 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│临清县十八村梁庄 │无 │否 │30 │
├─────────┼────┼────┼──┤
│临清县十八村贡庄 │无 │否 │30 │
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十二里庄总铎区：
┌───────┬────┬────┬──┐
│村庄名称 │有无教堂│住神父否│人数│
├───────┼────┼────┼──┤
│武城县十二里庄│有 │住 │1400│
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│武城县吕洼 │有 │住 │350 │
├───────┼────┼────┼──┤
│武城县小郭庄 │有 │否 │100 │
├───────┼────┼────┼──┤
│武城县吕化庄 │有 │住 │200 │
├───────┼────┼────┼──┤
│武城县窑上 │有 │否 │100 │
├───────┼────┼────┼──┤
│武城县郭庄 │有 │否 │150 │
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聊城总铎区：
┌───────┬────┬────┬──┐
│村庄名称 │有无教堂│住神父否│人数│
├───────┼────┼────┼──┤
│聊城南关 │有 │住 │380 │
├───────┼────┼────┼──┤
│聊城楼北 │有 │住 │250 │
├───────┼────┼────┼──┤
│聊城县小店子 │有 │否 │150 │
├───────┼────┼────┼──┤
│聊城县果子王庄│有 │否 │120 │
├───────┼────┼────┼──┤
│莘县西关 │有 │住 │200 │
├───────┼────┼────┼──┤
│冠县王泉 │有 │住 │150 │
├───────┼────┼────┼──┤
│堂邑县范王庄 │有 │住 │150 │
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张庄总铎区：
┌───────┬────┬────┬──┐
│村庄名称 │有无教堂│住神父否│人数│
├───────┼────┼────┼──┤
│茌平县张庄 │有 │住 │400 │
├───────┼────┼────┼──┤
│茌平县姚张庄 │有 │住 │300 │
├───────┼────┼────┼──┤
│茌平县刘集 │有 │否 │50 │
├───────┼────┼────┼──┤
│茌平县杭庄 │有 │否 │40 │
├───────┼────┼────┼──┤
│茌平县焦庄 │有 │否 │80 │
├───────┼────┼────┼──┤
│茌平县刘庄 │有 │否 │40 │
├───────┼────┼────┼──┤
│茌平县马家沙窝│无 │否 │30 │
├───────┼────┼────┼──┤
│博平县玉皇庙 │有 │住 │200 │
├───────┼────┼────┼──┤
│博平县蒋庄 │有 │住 │150 │
├───────┼────┼────┼──┤
│博平县张大苟庄│有 │否 │100 │
├───────┼────┼────┼──┤
│清平县戴庄 │有 │住 │120 │
├───────┼────┼────┼──┤
│清平县柴庄 │有 │否 │80 │
├───────┼────┼────┼──┤
│清平县张官屯 │有 │否 │80 │
├───────┼────┼────┼──┤
│清平县吕庙 │无 │否 │30 │
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主教堂直辖：
┌─────┬────┬────┬──┐
│名称 │有无教堂│住神父否│人数│
├─────┼────┼────┼──┤
│达鼓巷 │有 │住 │60 │
├─────┼────┼────┼──┤
│若瑟修道院│ │ │ │
├─────┼────┼────┼──┤
│若瑟仁爱会│ │ │ │
└─────┴────┴────┴──┘
境内天主教严守教规、礼仪，相信“耶稣救世”和“信主死后升天”等。其主要活动：
民国19年(1930)秋，小修道院(若瑟修道院)成立，有从济南调回境内的修生8人(后2人进大修道院)，又招收新生5人，院长宗安和。小修道院为八年制，学习小学、中学课程和教会道理及拉丁文。民国24年(1935)秋，小修道院迁入板井街十字楼。民国30年(1941)春，主教李荩臣住进楼内，搬入平房的修生对此不满，约有三分之一离开修道院。民国34年(1945)九月下旬，卫东中学(今市第一中学前身)迁居小修道院。民国35年(1946)六月，小修道院解散。
1930～1945年小修道院历年招生情况一览表
┌─────┬────┬─────────────────┐
│招生日期 │招生人数│备注 │
├─────┼────┼─────────────────┤
│1930年9月 │5 │原则上每二年招生一次。 │
├─────┼────┤因初成立，修生较少。 │
│1931年9月 │9 │前四年每年招生一次 │
├─────┼────┤ │
│1932年9月 │7 │ │
├─────┼────┤ │
│1933年9月 │9 │ │
├─────┼────┼─────────────────┤
│1935年9月 │12 │招考毕，即迁入达鼓巷 │
├─────┼────┼─────────────────┤
│1938年9月 │22 │因抗日战争爆发，推迟一年招生 │
├─────┼────┼─────────────────┤
│1940年9月 │22 │因修生离院，提前一年招生 │
├─────┼────┤ │
│1941年9月 │17 │ │
├─────┼────┼─────────────────┤
│1945年9月 │21 │因1943、1944两年灾荒、推迟二年招生│
└─────┴────┴─────────────────┘
民国24年(1935)十月，神父李仲达在达鼓巷路东，成立若瑟仁爱会，为华籍修女会。会址有楼房1座，平、瓦房30余间，经费自筹。由北京请来的修女张洁清、牛德兰分别担任院长、副院长。民国27年(1938)九月开始招收新生，凡18岁以上的未婚女性教徒，高小毕业，志守终身者，皆可入会。被批准入会者，均废其原名，不改姓。第一批学员的名字，最后一字皆为“敏”字，如：王×敏、李×敏等；第二批学员的名字皆为“仁”字，如：赵×仁、黄×仁等。前后共招生近40人。民国37年(1948)若瑟仁爱会解散，修女还俗。
临清教区初建时，拟请德国神父罗义孚为顾问，以爱国神父胡嘉禄为首的绝大多数神父，联名上书胡修身主教，请求自治，最终得以实现。胡嘉禄，名翼之，字嘉禄，武城县人，民国24年(1935)至民国30年(1941)十月，在境内小芦村任本堂神父。其间掩护冀南军区印刷所，刊印抗日救国书籍等，做了一些抗日工作。建国后，曾任临清政协委员。1960年10月胡嘉禄逝世，人民政府有关部门为其召开追悼会，肯定其作出的贡献。天津和上海的天主教爱国会刊物《广场》、《信鸽》曾刊登胡嘉禄的事迹。
50年代，人民政府积极贯彻党的宗教政策、支持小芦村教徒成立小芦村天主教爱国会，主任田凤岐。“文化大革命”开始后停止活动。
1950年10月，小芦村教徒李紫英由天津传来“圣母军”。“圣母军”系源于爱尔兰披着宗教外衣的反动组织。专门破坏教徒发起的爱国、爱教、反帝运动。田风岗、李紫英分别任正、副会长，神父冯学海任指导司铎。“圣母军”活动近三四个月，1951年被取缔。