清光绪十五年(1889)，知州陶锡祺在城乡共创设牛痘局4处。光绪二十八年(1902)，知州庄洪烈捐俸设局施药，设坛驱疫。民国初年，车指南捐款筹建牛痘局3处。这是当时疫情防治的一般机构，对于大的流行病防治仍束手无策。旧志载，民国7年(1918)城东赵庄、仓上等地霍乱流行，仓上村全村不到500人，死亡百余人，侯世范一家7人死亡6人，张传生一家7人死亡2人，侯言广一家3人皆死于霍乱。
民国9年(1920)霍乱流行时“处处有哭声，村村有新茔”。同年城里霍乱大流行，“街街有人亡，处处闻泣声”，抬棺人发病身亡者屡见不鲜。桃园街医生李寿其夜间出诊，第二天染病身亡。民国26年(1937)冬，天花、麻疹、瘟疫于城东一带流行，仓上村张家胡同张广山一家18人，死于天花的3人，死于麻疹的2人，死于瘟疫的3人，死于其他疾病的1人，共死亡9人。民国9年(1920)原华美医院开始为地方举办栽种牛痘训练班。结业后回各区，每两人为一队施种牛痘，减少了天花病的发生。对预防霍乱、伤寒病的知识亦常作宣传，并接种疫苗。
1951年，贯彻政府“预防为主”的卫生工作方针，开展群众性的爱国卫生运动，进行预防接种。70年代又开展“计划免疫”工作，建立法定传染病报告和“消毒、杀菌、灭害”的制度，有效地控制了各种传染病的发生，发病率逐年下降。霍乱、天花、回归热、黑热病、白喉等已消灭，斑疹伤寒至1962年3月，市监狱发生16例，以后再无发病，疟疾、伤寒已基本消灭。1987年开始实行疫苗冷藏运转，即“冷链运转”，1988年运转6次，制作冰块1万块，接种各种疫苗26万人次，0～4岁儿童48752人参加了计划免疫保险，投保率90％。平均年发病率由50年代的7581.55/10万，下降到3897.98/10万。
1989年8月，对全市20个乡镇和办事处抽查，“四苗”接种率92.83％，建卡率96.67％，用卡率93.81％，卡介苗接种率为93.81％，卡疤率69.52％，百白破93.33％，麻疹疫苗接种率92.26％，脊灰服苗率93.87％。