清末，临清为直隶州，主要职官设有知州、州同、州判、学正、训导、吏目、巡检、闸官等，各官署设幕友和书吏。
知州 掌一州之政令，品级为从四品。州同、州判为知州的佐官，其秩禄分别为正五品、正六品。州同分掌粮运、盗捕、消防、江防、清军、理事、抚苗、水利等事。州判分掌粮运、督捕、水利、理事诸务；吏目掌刑狱；巡检掌捕缉盗贼；学正、训导掌教育、科举。
民国初年，临清废州改县。设立县公署。设县知事1人(后称县长)。其职权为：受省政府的监督，办理全县自治事项；受省政府的指挥，执行中央及省的委办事项。县公署(后称县政府)下设法官、检察官、公安局、财政局、建设局、教育局等机构。
法官 民国初年知事兼司法，设承审员1人。民国17年(1928)六月司法独立，设县法院，置审判官、检察官各1人。民国22年(1933)一月，改为济南地方法院临清分庭。管狱员由清吏目改缺。民国17～22年(1928～1933)临清共有审判官6人、检察官5人、管狱员8人。
公安局 清光绪三十四年(1908)设警察局，局长称区官。民国2年(1913)更名为警察事务所，所长称警佐。民国16年(1927)改为警察所，警佐改为所长。民国17年(1928)改为公安局。自民国元年(1912)～22年(1933)共有区官、警佐、所长、局长28人。其职责为：掌警卫、消防、卫生等。
财政局 民国7年(1918)十二月，成立财政管理处，处长名为财政管理员。民国17年(1928)奉令改为财政局，管理员为局长。民国23年(1934)一月改为县署第三科。历代长官均为本县人。负责征税、募捐、管理生产和地方财政。
建设局 民国9年(1920)成立劝业所，设所长1人。民国13年(1924)七月，改为实业局。民国22年(1933)一月，改为县署第四科，管理森林、水利、交通及其他公共事业。
教育局 清末废科举兴学校，光绪三十二年(1906)裁学正一缺，改设视学，又推地方绅士1人董其事，名为总董。宣统二年(1910)八月设劝学所，置劝学员长1人。民国2年(1913)改为视学所。民国5年(1916)又改为劝学所，称主管所长。民国12年(1923)改为教育局，所长为局长。民国22年(1933)一月改为县署第五科，掌管学校及其他文化事业。
民国28年(1939)，根据国民政府规定，县府下设：民政、财政、教育、建设、军事、地政、社会各科。各科设科长1人、科员若干人。