1956年前，卫生防疫工作由县卫生院防疫股负责。县卫生防疫站成立后，各项卫生防疫工作逐渐有专人分管。各区（乡、公社）卫生所建立后，卫生防疫工作逐渐延伸到基层。1974年，防疫站设立卫生组，添置了监测仪器，工作效率明显提高，1985年，达到了卫生学的要求。
〔食品卫生〕
1951年，贯彻《山东省农村集镇卫生管理暂行办法》。1952年，为粉碎侵朝美军发动的细菌战，县内掀起爱国卫生运动。除害灭病，强调注意饮食卫生，借集市和物资交流会之际开展食品卫生宣传。年内全县有9000个家庭添置了卫生设施。1955年始，大型集镇设立卫生检查小组。1957年贯彻《饮食业卫生管理办法》，对饮食从业人员进行培训，颁发卫生许可证。1958年7月28日，孙镇公社信家大队32户163人因食病牛肉中毒，县、社卫生机构组织力量及时抢救，仅死亡1人。1958-1960年，推广饮食卫生“五四”制，对各单位食堂卫生状况进行了检查，4516名食堂人员参加了培训，327名炊事人员进行了查体，其中20余人因患传染病被调离原职。三年经济困难时期，群众因食用棉籽、病死畜肉和各种野菜，发生中毒事件70余起，患者5866人。县社卫生机构全力进行抢救，仅死亡44人。1962年，贯彻预防为主的方针，各区建立健全集市卫生管理委员会。1963年，要求集镇饮食摊贩必须经过身体检查，具有防蝇防尘等卫生设施，取得卫生许可证后方准营业。至1965年，参加食品卫生知识培训和年度体检的有食品加工人员100余人，饮食经营人员543人，炊事员193人。
1966年6月后，受“文化大革命”冲击，县卫生防疫机构陷于瘫痪，食品卫生工作长期处于无人管理状态。1970年6月，郑马公社里八田村群众因食用变质牛肉，147人中毒，1人死亡，引起了县卫生机构的重视。9月下旬，县爱卫会组织56人，分组对全县16个饭店、18个食品站、102个机关及企事业单位食堂和3个食品厂进行全面卫生大检查。1971-1976年，每年夏秋之间对全县食品厂、饭店、公共食堂进行检查，为合格食品代销员发卫生许可证。1975年5月，贯彻《肉品检验操作规程》，县举办食品卫生监督员培训班，配合商业局对食品行业进行卫生大检查，共查108个单位，西董饭店、长山饭店、码头食品站基本达到无蝇卫生标准。
1981年6月，县府成立食品卫生领导小组，设置办公室，对45个食品加工和饮食服务单位进行检查，换发卫生许可证。1984年秋，县卫生防疫站设立食品卫生科，充分发挥食品卫生监督员作用。1985年，贯彻食品监督和指导相结合原则，健全卫生制度。1977-1985年，共举办卫生监测培训班5期，培训人员510名，检查食品单位3564个次，体检从业人员15809人。调离有就业禁忌症人员602人，对查出的不合格食品及时进行处理。
〔劳动卫生〕
工人卫生 建国后，党和政府关心工人农民的劳动卫生。1960年，县内制定工业卫生计划，对防毒、防尘、防病、防伤、防暑降温以及女工劳动保护作出具体要求。同年，对全县28个工厂炊事人员进行查体。为部分工矿企业配备16名卫生人员，在9个厂矿建立卫生室。1963年，开展矽肺病调查，在机械一厂和九户等3个油棉厂轧花车间进行粉尘浓度测定，查出矽肺病患者5人，有关单位及时改善卫生设施。1971年，对全县工矿企业2121名职工进行全面健康检查，查出病人227人，其中44名就业禁忌症患者得到及时休养与治疗。1975-1979年，先后3次为1153名粉尘作业工人进行查体，发现零至一期矽肺病患者1人，其他肺疾患者5人。1978年对全县96个厂矿企业进行卫生学调查，发现42个单位产尘（接触粉尘工人1504人)、4个单位产毒(接触毒物工人265人)，对粉尘浓度过高单位提出改进意见。县化肥厂锅炉车间粉尘浓度超过国家标准29.26倍，改进后降至4.8%。1981年，开始使用医用诊断X线机，至1982年5月，全县共有25部，其中一半安装了防护设备。加强了厂矿企业经常性卫生监督，对原有4名苯中毒和13名尿氟偏高工人进行查体，经治疗痊愈。对130名挖煤工人进行X线拍片，对7个有粉尘作业的工厂进行测尘，对部分厂矿进行震动病调查，为做好防尘、防噪音提供了一定数据。1983年为X线机从业人员建立档案。1985年20个医疗单位23部X线机防护装置进行全面检查，发放“X线防护合格证”。要求19个县属企业建立劳动卫生和职业病档案，65个乡镇企业建立“劳动卫生卡”。
农民卫生 1955年，县卫生工作者协会组织40名地方医生，分18个小组于夏秋大忙季节到农村田头巡回医疗，诊病380余人次，培训保健员109名，发保健箱312个。1956年，全县高级农业生产合作社都建立保健室，有保健员306人。1960年4月，农村广大群众因生活困难，体质下降，加之气候异常，时有中暑发生。县组织医生巡回医疗，设立180处开水站，预防中暑。1964年5月下旬，县卫生、公安、供销3个单位组成联合检查组对5个主要产棉区剧毒农药的种类、存放状态、使用情况、器械准备以及急救药械准备，防治人员培训等进行重点检查。产棉区成立农药技术指导委员会，培训农药使用人员，配备急救箱，通过广泛宣传使社员了解剧毒农药对人体的危害和预防方法。1965年7月下旬，县计委、卫生局、总工会下达《做好防暑降温的联合通知》。夏秋农忙季节组织基层人员巡回医疗1820次。强调农田劳动实行“两早、两晚、一延长”作息制度。1982年，县府成立农药中毒防治领导小组，各公社建立抢救小组。县社分别举办农药中毒防治学习班，发放630份农药中毒防治简明表，5000份宣传资料和部分防治手册。检查表明：中毒人数由1981年的574人下降到1982年的150人，未发生死亡事故，受到省卫生厅表彰。
〔环境卫生〕
50年代初期，贯彻《山东省夏季清洁卫生大扫除运动实施办法》和《山东省农村集镇卫生管理暂行办法》，结合粉碎侵朝美军发动的细菌战，全县城乡确定爱国卫生日，订立卫生公约，开展环境卫生扫除。1953-1955年，农村结合生产积肥运动，拆除旧坯墙，建造新厕所。1956-1962年，农村强调粪便统一管理，城镇沿街修建公共厕所，设置垃圾箱，开展“三洁、四灭”(街道整洁、院落整洁、室内整洁、灭蝇、灭蚊、灭虱、灭蚤）运动。1957年10月，全县出现12个“三洁四无（无蝇、无蚊、无鼠、无麻雀）村”、68个“三洁村”。1963-1978年，培训环境卫生管理人员，进行饮用水源调查，改造水井设施，加强饮用水源保护，进行饮水消毒，以及整修街道等，培训消毒员372人，消毒水井7283眼，改良水井6396眼，改良厕所2657个，烟熏旧房123652间，整修街道866条，建沼气池64个，打手压机井1117眼，对预防付霍乱发生、疟疾传染、杜绝肠道病流行发挥了作用。1979-1981年，开展饮用水源卫生调查，进行水源水质分析，改造饮水设施，共查11个公社210个大队270眼水井，重点是小清河、孝妇河两岸50米内的饮用水污染情况。通过对96个样品检验，证明基本未受污染。1982-1985年，对县城驻地大气污染和饮水含菌情况进行卫生学监测，在邹平影院门前、农机局门前和三八水库设点3处得大气采样108份，检验证明含有氧化硫和氢氧化物，县磷肥厂的氟化氢气体污染超国家规定标准40倍，污染范围在2000米以内。县直单位饮水有细菌数超标。县医院污水沟、洗衣房所排污水均含有福氏痢疾菌和副伤寒干菌等致病菌，均对其污染源进行了治理，保证了环境卫生。
〔学校卫生〕
1952年，贯彻毛泽东主席“发展体育运动，增强人民体质”的指示，首先在邹平、长山、魏桥3处中学配备校医。至1958年，各完全中学都相继配备校医或保健教师，建立卫生室。县防疫委员会统一部署对全县学生进行卫生教育，发动师生开展卫生扫除。号召学生积极投入捕鼠灭蝇活动，改善学校卫生面貌。1962年，县防疫站为学校配备专职卫生人员，对县内部分中学、完小学生的肠道传染病、寄生虫病、砂眼等防治情况和视力进行调查，帮助有关学校建立卫生制度。1979年，恢复高考制度以后，部分中小学由于片面追求升学率，忽视学生健康，致使学生体质下降，疾病增多。县防疫卫生站对南北寺学校、码头联中、南关小学进行健康检查，共查1474人，查出砂眼患者139人，视力减退者95人，龋齿患者206人，蛔虫感染者480人，合计1020人，占所查人数的60%。
为了扭转学校卫生恶化状况，1980年培训保健教师40人，配合有关单位对学校进行卫生检查。至1985年，对55处中小学进行卫生现状调查，对6处重点中小学进行体育卫生调查，对4处联中31处小学153个班进行卫生学调查，对7处中小学进行视力调查，约查5000人次。对邹平一中1600名学生肺活量进行监测。对1278名学生进行健康检查。为19处中学建立学生卫生档案，为邹平一中、长山中学和魏桥中学3校3000余名学生建立健康卡片。