1937年“七七”事变后，日军侵占华北。年底渡过黄河，进占胶济沿线。12月26日，在中国共产党的领导下，以长山中学革命师生为主，在长山九区黑铁山举行武装起义，成立山东人民抗日救国军第五军，揭开了清河平原武装抗日斗争的序幕。为了打击敌人的嚣张气焰，扩大抗日队伍的影响，山东抗日救国军第五军在奇袭长山城后，一部留在长山九区卫固继续扩大队伍，开展地方工作，姚仲明、廖容标则带基干队伍开到焦桥一带，与李寿岭联系，开展地方游击战争，扩大政治影响。马耀南到长山八区，协助马函三组织抗日武装。经过小清河伏击战，三官庙战斗，重创了敌人，第五军声威大震。邹、长、桓、章、历、齐等县的抗日游击队纷纷聚集在五军的旗帜下，队伍发展到5000余人。1938年3月，第五军进驻邹平城进行整编，成立抗日民主政府，发动群众进行敌后抗战。6月，第五军改编为八路军第三支队。投机混入五军的张景南与高竹君拒绝改编，制造分裂，叛变革命。7月，张景南趁三支队主力东进临淄、后方空虚之机，突然袭击邹平城的三支队司令部。三支队主力遂抽一部星夜回师，讨伐叛军，抄袭六团东范据点。9月，又击溃11个土顽司令的联合进攻。三支队在斗争中越战越强，为开辟邹、长抗日根据地打下了坚实的基础。
1938年秋，日军在华北进行所谓“整肃作战”，组织伪军，建立伪政权，开始对敌后抗日武装进行大规模“扫荡”。邹平的保安六团与齐东的保安第九旅勾结日军，疯狂地进行“反共、限共、溶共”政策，三支队处于腹背受敌的局面。10月，清河特委在临淄苇子河召开县委书记会议，明确提出建立抗日根据地，恢复发展党的地方组织，壮大八路军和地方武装，开展敌后游击战争。由于当时没有根据地为依托，蒙家庄战斗、邹平城突围，抗日队伍受到了一定的损失。1939年，三支队加强对地方工作的领导，开始建立地方政权。4月，为了打通与冀鲁边区的联系，马耀南率三支队主力西进。历经司家庄、爱贤村、田李靳等战斗，重创敌人，取得了第一次西征的胜利。6月，三支队第二次西征，激战刘家井、血战牛王庄，重创日军，司令员马耀南不幸壮烈殉国。7月，清河特委在长山傅村召开会议，总结经验教训，部署建党、建军和加快创建平原根据地，坚持平原抗战的工作。此后，邹、长地区的地方武装迅速发展，出其不意地打击敌人。除几个县城外，南起长白山、北至陶唐口、西起刘家井、东到卫固的大片土地都在抗日队伍的控制之下。
1939年11月，三支队回师清河平原，分三路越过胶济线。中、东两路直插小清河北，继而进入清水泊地区。西路在李曼村、韩子衡带领下，迅速插到长山一带，在群众条件好的焦桥、旧口、十八套、西董一带发动群众，建立基层政权，创建抗日根据地。采取分散、隐蔽和两面斗争策略，有力地粉碎了日军的“扫荡”和伪顽的“磨擦”。1940年，长山县、邹平县抗日民主政府先后成立，进一步巩固和扩大抗日根据地。根据地发展到邹平县的小店乡、崖镇乡、吴家乡，长山县的五区、六区、七区、八区，计207个村庄。邹平县的明集乡、韩店乡、三官庙乡及长山县的三区、四区的208个村庄变成经常有抗日部队活动的游击区。
1941-1942年，日军对抗日根据地和抗日部队进行长期连续的反复的大“扫荡”，连续推行五次“治安强化”运动，开始对根据地进行分割、“围剿”、“蚕食”，抗战进入最艰苦的阶段，国民党顽固派公开投敌，抗日武装采取内线坚持，外线出击，化整为零，“翻边”战术，坚持反“扫荡”、反“蚕食”、反“围剿”，经历了无数次的战斗，日伪军军事上“围剿”，经济上封锁，使根据地区域大大缩小。北部小清河以南仅剩韩刘二套、东西直、东西杜、三元、东平、四马等32个村庄。南部长白山区只剩杨家、于家桥、韩家、皇后、会仙、陈化、东窝陀等49个村庄。根据地内共约3.67万人。最后长白山区只剩下最里边的七、八个村庄，敌人始终未能踏进一步，被誉为邹长地区的“小延安”。长白山根据地的建立和巩固，形成了联系清河、胶东两大战略区与鲁中省抗日领导机关的交通枢纽，对转运干部，运送物资起着重大的作用。
1942年秋，为加强邹长地区的抗日力量，保卫这一“红色走廊”，清西分区党委派张维滋率一个基干连队进入长白山区。同时遵照山东分局“不要丢了小清河南”的指示，重新成立中共邹平县委。成立武工队，建立村政权，组织抗日团体，把敌占区变成游击区。1943年，斗争形势进一步好转，八路军清西独立团和邹、长地方武装在广大人民
群众的配合下，拔据点，平封锁沟，打击小股敌人，逐步改变了邹、长抗日根据地被分割封锁的局面，逐渐形成了南起长白山，北至陶唐口，再东北至广饶北隋的狭长形抗日根据地。
1944年，抗日斗争形势由长期坚持转向局部反攻。日军在抗日军民的不断打击下，开始收缩兵力，转攻为守。渤海区党委制定了局部进行反攻的战略决策，清西独立团，邹平、长山县大队，长桓县大队等向敌伪军展开了局部的反攻。激战孝妇河、马庄伏击战、信家庄战斗、焚烧三据点、巧夺蒙家庄，给敌人以重大杀伤。敌人龟缩在据点里不敢轻易出来，根据地迅速扩大。邹平县的韩店、明集、青阳、花沟等乡和长山县的三、四、五、六、七、八等区443个村为抗日政权控制，根据地面积已占邹平、长山两县的大部，根据地人口达14万人。
1945年春，全县人民在“扩大主力，准备反攻”的号召下，掀起轰轰烈烈的大参军运动。为配合战略大反攻，人民抗日武装奇袭碱场店，智取无影山，激战太平庄，拔除李家庄据点，取得一次又一次的胜利。8月14日，日本宣布无条件投降。渤海军区主力在地方武装配合下，组成南、中、北三路大军，沿胶济线和小清河自东向西横扫日军，相继连克邹、长、齐三座县城，取得八年抗日战争的伟大胜利。邹长抗日根据地在这一革命斗争史上写下了不朽的一页。