1940年7月县抗日民主政府成立，废除“保甲制”，建立区公所，实行行政村制。将银两征收改为市亩征收，推行合理负担，确定征收田赋的合理标准。组织群众大挖交通沟，抗日根据地各村有交通沟相连，改造地形，坚持平原游击战。1942年在日军实行烧光、杀光、抢光政策残酷扫荡时期，清河区党政领导机关移驻博兴根据地。是年，贯彻中共中央和山东分局关于精兵简政的指示，县区干部精减百分之三十，促进机关战斗化，减轻人民负担。同年，三、六区开展减租减息增加工资，民主反霸斗争，削弱了地主封建剥削，农民生活得到改善。1944年至1945年县抗日民主政府，领导抗日军民开展大生产运动，县、区、村成立生产指导委员会，组织插伙组、合作贸易。当地土布生产自给有余，棉籽油代替煤油照明，机关学校开荒种地，解决了敌人军事包围和经济封锁所造成的困难。1945年3月中共博兴县委县政府在王家官庄召开县区村干部大会，总结动员参军工作的同时，发动春季大生产。全县形成组织生产合作，开展大生产高潮。九区参加插伙组农户占总农户的73%，劳动力占95%。1945年7月全县发生蝗虫危害，县委、县政府成立灭蝗指挥部，县长唐鲁夫亲自到田间视察指挥，军民奋战50天，战胜蝗灾。12月16日县委、县政府在贤城村（今属博兴镇）召开群英大会，总结表彰全年大生产经验。评选出王凤祥、韩秀贞、杨恒伦3名劳动英雄和一批先进集体。24日王凤祥等3人参加渤海区劳模大会。1946年3月中共渤海区党委发出通知，表扬博兴县1945年生产工作成绩，并在全区推广博兴经验。冬，开展土地改革运动，1951年结束，将60.6万亩土地分给无地少地的农民。
1948年夏，县委、县府加强夏防工作领导，保卫人民安全生产。5月成立县夏防指挥部，区、乡、村分别成立中队、分队和小队，开展反特剿匪活动。县公安局配合独立营到小清河南开展清剿。7月，公安局政卫队培训各乡、村侦察员，全面铺开夏防工作。
1948年8月县政府成立支前委员会，县长唐鲁夫任主任委员，王健民任副主任委员，另有3名委员组成。8月派出运粮队、民兵团、渤海子弟兵团、担架团支援济南、淮海、渡江战役，全县支前民工民兵达10000人次。至年底，全县在解放战争中有6455人参军，2455人参政。同时，全县支援前线粮食数百万斤，大批土布、裹腿、军鞋等物资。
1948年，本县发生涝灾，受灾面积达141321亩，县委县府积极领导群众生产自救，向严重的176个村9406户农民发放贷粮459792公斤。1949年虫灾水灾严重，县府拨粮食30.5万公斤救灾。
1949年夏秋，黄河出现特大洪峰，中断南北交通43天，县政府动员1500民工上堤抢险，并投入大批石、木料，战胜洪水。
1950年10月，六区卢家村（今属阎坊乡）互助组长卢奎法参加全国工农兵劳动模范代表大会，登上国庆观礼台，受到毛泽东主席、周恩来总理接见。县委、县府推广他的经验，推动全县农业互助合作运动发展。
1951年，县人民政府重视教育事业，努力提高全民文化素质。年底县有中学1处，学生100人；高小7处，26个班，1471人；小学339处，321个班，18378人，实现入学率98%0
1952年夏季干旱，秋季疾病流行。9月27日县府成立生产救灾工作委员会。决定：1.重灾区、乡成立生产救灾委员会，确定生产救灾为冬春中心工作；2.开展宣传活动，改变群众消极悲观情绪，树立战胜灾荒的信心和决心；3.帮助群众解决种子、肥料等困难，种足种好小麦；4.因地制宜，组织开展副业生产，增加群众收入；5.继续发动互助合作运动，团结起来战胜灾害。年底，全县共有互助组5335个，参加农户占全县总户数的65.7%。
1955年6月，执行国务院《关于建立户口工作经常登记制度》的指示，县府决定由县民政局加强这项工作的领导，从此户籍建设逐步走上正轨。9月贯彻省人民委员会《农村统购统销暂行办法实施细则》，实行粮食定产、定购、定销到户。促进了农业生产发展。县委县府连续召开会议，贯彻毛泽东主席关于农业合作化的指示，是冬掀起农业合作化高潮，全县农业生产合作社由上半年的224处，入社7064户，增到1170处，34333户，连同互助组农户，占全县总农户的70.4%。
1956年县委、县府在推动农业互助合作化运动的同时，对私营资本主义工商业进行社会主义改造。将全县800余户私营工商业分别纳入国营、供销社经营和合作经营。5月县府组织3531名民工参加打渔张引黄闸和一、二干渠工程。11月30日打渔张引黄闸建成放水，扩大水浇面积14万亩。
1958年“大跃进”，上半年县委、县府组织农业生产，成果显著，庄稼长势好，丰收在望。但下半年在左倾错误影响下，做了许多徒劳的工作，先后调集50万人上阵“大炼钢铁”，致使秋收缺劳力，粮食损失严重。
1960年至1962年，县委、县府全面贯彻中共中央“调整、巩固、充实、提高”的方针，努力纠正“五风”和“平调”错误，清理1958年至1960年“平调，，总值3340万元，1960年12月底追还1112万元。1961年4月接受地区赔偿“平调”款723万元。组织干部慰问重灾区，开展生产救灾。仅1961年就发放救灾款万元，银行低息生产贷款192万元，无偿投资万元，商业、物资、供销部门生产投资供应总额339.6万元。1961年为战胜灾荒县府提出开展“一、二、三、五”运动，即全县每人平均一亩水浇地，二分瓜菜，三分早熟作物，种好五分小麦。实行“精兵简政”，撤并科局15个，下放干部2068人，占全县干部总数的43.2%，减轻人民负担。
1964年发生百年不遇的大水灾，县政府组织党政军民全力投入抗洪斗争，奋战2个月，疏通沟渠4000条，战胜洪涝灾害。政府拨统销粮250万公斤，救济灾民。
同年秋，县委、县人委组织名干部深入基层，对3年来4120名城市回乡、下乡人员的安置情况进行详细检查、访问、登记。表彰在阶级斗争、生产斗争和科学实验中起到模范带头作用的先进人物和事迹。各区、公社分别召开代表会和座谈会，鼓励他们安心从事农业劳动。
1965年秋，响应毛泽东主席批示的“农业学大寨”运动，组织万人水利会战清淤夹河，挖大小台条田6万亩，达到日降雨150毫米不成灾。“农业学大寨”运动，对农田水利建设改变生产条件起了好的作用。但缺乏长远统一计划，也浪费了不少人力物力。
1971年冬至1972年春，博兴县革委组织稻改工作队进驻纯化、乔庄、蔡寨等公社部分大队引黄压碱，旱地改稻田8万亩，与群众同吃同住同劳动，取得实效。同时县、社共同对小清河南五公社进行了统一规划，分别施工，达到田成方、路成网、水成系、树成行，基本实现园林化。
1981年至1983年，县政府积极执行和落实县人大第九届第一、第二次会议关于加强推进农业经济体制改革的决议，多次组织工作组、调查队，深入农村调查访问，制定具体计划和措施。1983年底，全县普遍推行联产承包责任制，调动农民生产积极性，在全县土地减少3.53万亩的情况下，粮食总产比上年增长22.03%。
1985年县委、县府动员全民为全面完成国民经济第六个五年计划，加快“改革开放经济搞活”步伐，取得可喜成绩。农业总产值达到28484万元，社会商品零售额达15103万元，财政收入完成872.5万元，城乡储蓄达4542万元，分别比1978年翻一番多。
附：日伪政权
1939年1月日军侵占博兴县城后，组织维持会，建立伪政权——博兴县公署。1938年3月日伪华北临时政府成立山东省公署伪政权，下属鲁东鲁西鲁北鲁南道，博兴县公署，属伪鲁北道，1940年汪伪南京政府成立，山东省划为10道，博兴县公署属青州道。县长称县知事。首任县知事白宇平（白光正）。伪县公署设民政科、财政科、建设科、教育科、政务警（两个班）及警察所（后改警务局）等机构。伪县公署依靠日伪军的保护设在县城内。
日伪统治区域，主要为县城附近各村，即一区各乡村，以及不断设立的据点岗楼多处。一区伪区公所设县城内。实行保甲制，户为甲，10甲为保，设保长、甲长，全县境内先后安设据点22处，岗楼9个。1945年8月，日侵略军投降，伪政权覆亡。
附：伪县知事名单
县知事 任职年月
白宇平 1939.2-1940.12
程联甲 1941.1-1943.12
田树荣 1944.1-1945.2
何 雍 1945.3-1945.8