清代博兴县衙，置知县（正七品）1人，统管地方政务；主簿（正九品）1人，主管文书典令事宜；辅佐官员有典史1人，主管监狱犯人；教谕（正八品）训导（从八品）各1人，主持文庙祭祠，宣传儒家经典和皇帝训试教诲，管束生徒；巡检（从九品）1人，专司巡缉、维护要冲治安。办事机构设置六房：
吏房：掌全县官吏之升授注册，及六房印簿。
户房：掌丁赋银两、灾情、课税、盐务。
礼房：掌孔庙祭祀、大典、文教。
兵房：掌兵事和境内驿站铺递。
刑房：掌狱诉。
工房：掌城池、坛庙、官署仓房的修建及河道治理工程。清光绪二十七年（1901年）设巡警营，置巡官，又改区官。光绪三十二年（1906年），县衙署设皂、快、捕班，撤巡警营改设巡警局，统辖巡队队兵30人，负责地方治安。
清末，县衙署内增壮班和库房、招房。刑名、钱谷类皆由知县延聘幕宾担任，随本任官去留。清宣统元年（1909年），废科举，撤教谕，设劝学所，初称劝学总管，后改称所长，总理全县学务。知县审理刑事、民事诉讼，行使司法审判权。
清代博兴知县更迭表（1840年始）
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┃ 姓名 │ 任职时间 │ 学衔 │ 籍 贯 ┃
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┃周任福│道光二十年（1840年） │附贡 │江苏省昭文县┃
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┃王 佑│道光二十一年（1841年） │举人 │河北省 ┃
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┃胡学醇│道光二十二年（1842年） │监生 │北京市宛平县┃
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┃潘 锈│道光二十三年（1843年） │进士 │安徽省怀远县┃
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┃汪南全│道光二十三年（1843年） │举人 │江苏省甘泉县┃
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┃杨德懿│道光二十四年（1844年） │进士 │陕西省武功县┃
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┃魏振奎│道光二十五年（1845年） │举人 │陕西省商州 ┃
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┃杨忠华│道光二十六年（1846年） │ │天津 ┃
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┃彭启昆│道光二十七年（1847年） │举人 │江西省分宜县┃
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┃王庆恩│道光二十八年（1848年） │举人 │辽宁省宁远县┃
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┃王奇祥│道光二十九年（1849年） │举人 │山西省平南县┃
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┃李树三│道光三十年（1850年） │附贡 │广西省平南县┃
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┃沈其昌│咸丰元年（1851年） │拔贡 │北京市宛平县┃
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┃孙善述│咸丰三年（1853年） │举人 │贵州省 ┃
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┃莫 炽│咸丰四年（1854年） │进士 │广西省荔浦县┃
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┃王 煊│咸丰五年（1855年） │ │湖南省善化县┃
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┃庆 纪│咸丰十年（1860年） │ │满州镶蓝旗人┃
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┃周丕沣│咸丰十一年（1861年） │进士 │四川省安岳县┃
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┃鞠 璞│同治二年（1863年） │优贡 │辽宁省宁远县┃
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┃魏正藻│同治六年（1867年） │优贡 │河北省昌黎县┃
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┃王保和│同治七年（1868年） │ │浙江省 ┃
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┃郑景福│同治十三年（1874年） │ │浙江省 ┃
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┃王保和│光绪元年（1875年） │ │浙江省 ┃
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┃陈愈元│光绪四年（1878年） │ │广西省临桂县┃
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┃王振禄│光绪五年（1879年） │优贡 │河北省易州 ┃
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┃杨建烈│光绪十二年（1886年） │ │浙江省 ┃
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┃赵秉仁│光绪十三年（1887年） │ │河北省清宛县┃
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（续表）
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┃ 姓名 │ 任职时间 │学衔│ 籍 贯 ┃
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┃耿棨昌│光绪十五年（1889年） │ │江苏省泰兴县┃
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┃李 铨│光绪十六年（1890年） │进士│天津 ┃
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┃刘桐荫│光绪二十一年（1895年） │举人│山西省 ┃
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┃罗继高│光绪二十二年（1896年） │举人│浙江省四明县┃
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┃梁锡祜│光绪二十三年（1897年） │举人│河南省鹿邑县┃
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┃钱应显│光绪二十六年（1900年）代理│ │安徽省怀宁县┃
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┃辅蓬先│光绪二十六年（1900年） │ │安徽省涡阳县┃
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┃白云逵│光绪二十八年（1902年） │优贡│辽宁省 ┃
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┃梁锡祜│光绪二十九年（1903年） │举人│河南省鹿邑县┃
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┃梅汝鼎│光绪三十年（1904年） │进士│江西省南昌市┃
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┃徐慰曾│光绪三十年（1904年）代理 │ │江苏省 ┃
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┃张鸿翼│光绪三十年（1904年） │举人│山西省芮城县┃
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┃王炽昌│光绪三十一年（1905年） │进士│山西省临汾县┃
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┃顾 珽│光绪三十四年（1908年） │举人│河南省祥符县┃
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┃梁廷揆│ │ │ ┃
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┃张昌庆│ │ │ ┃
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┃章萝宪│ │ │ ┃
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