滨州市工商行政管理局为正科级行政单位，行政编制20人。1991年9月24日，滨州市消费仲裁委员会经市政府批准成立。10月23日，经市编委批准撤销滨州市工商局滨城办事处，1992年6月成立滨州市工商局滨城一所和滨城二所。1993年2月成立滨州市工商局北镇工商所。1994年1月成立个体科。1995年6月，滨城工商一所、二所合并为滨城工商所，同月，成立滨州市工商局个体车站管理所。1996年上半年分别成立了蒲城工商所及彭李工商所。1997年机构改革，滨州市工商局进行了科室合并，经济检查所与市场管理科合并为市场管理科，会统科与办公室合并为办公室，个体科与企业科合并为企业科。是年1月成立市工商局法制科。截止1998年6月，滨州市工商局共设科、室、所33个，正式职工236人。
近几年来，滨州市工商局紧紧围绕改革、发展、稳定的大局，按照建立社会主义市场经济体制的要求和“发展经济、服务经济”的原则，解放思想，实事求是，充分发挥职能，强化执法力度，致力于为滨州市改革开放和经济发展创造良好的市场环境。按照“建立有权威的市场执法队伍”的总体要求，积极转变职能，加强市场执法。苦练内功，内强素质，外树形象，通过不断强化服务，规范执法。在自身建设、市场培育及管理、打击经济违法活动、支持企业产权改革和个体私营经济发展等方面均取得了较大突破。1991年以来，滨州市工商行政管理局连续6年被山东省工商局及滨州地区工商局评为系统先进单位，连续4年被省精神文明委员会评为省级文明单位。1995年和1996年连续2年被中共山东省委、省人大、省人民政府授予“二五”普法先进单位称号。