滨城区科技管理体系日臻完善。1982年滨州市科学技术委员会设立，列市政府正科级行政单位，1987年滨县科委与滨州市科委合并，单位级别未变。1997年滨州市机构改革后，市科委仍为正科级行政单位，内设计划管理科、专利技术市场办公室。 2002年滨城区科委改称为滨城区科学技术局（简称区科技局），内设办公室、业务科、专利技术市场办公室、科技情报所、科技服务部等机构。2004年滨城区科学技术协会（简称区科协）与区科技局合署办公，同年，区信息产业局（正科）与区科技局合署办公，区知识产权局（副科级单位）、区高新技术创业中心（正科）归科技局领导。2006年，区地震办公室（正科）与科技局合署办公。截至2007年年底，区科技局系统内设办公室、业务科、高新技术产业科、科学技术宣传普及部、信息中心、地震检测中心6个正股级科室和知识产权局、科技信息研究所2个副科级单位。
“科技兴滨”战略成为重中之重。1991年市委、市政府编制《滨州市科技兴市实施方案》。提出依靠科技“建强市，奔小康”的奋斗目标，组织实施“科技兴工”、“科技兴农”、“科技兴社会”的科技牵头战略。制定“七五”、“八五”、“九五”滨州市科技发展规划。2000年编制完成“十五”科技发展计划，2005年编制完成滨城区科技发展“十一五”规划。2006年印发《关于提高自主创新能力的指导意见》和《关于鼓励企业积极向上争取项目，提高自主创新能力的指导意见》。自2004年开始，滨城区先后获得全国科技进步先进县（区）荣誉称号，区科技局连续3年获得山东省科技工作先进集体，区知识产权局连续3年获山东省专利工作先进集体、专利执法先进集体。
至2007年，全区共有大中型企业技术开发中心及研发机构25家（国家级1家），省级以上高新技术企业24家（国家级4家），市级民营科技企业35家，各类科技人员9710人。科技成果转化率达到98%，科技进步对经济增长的贡献率达到46%。此外地震监测、防震减灾工作也取得良好成效，气象观测、气象服务对全区经济发展发挥了重要作用。