1996年，滨州市开始土地利用总体规划修编工作，1998年完成。规划编制经历四个阶段:（1）准备阶段：包括组织准备、成立领导小组、设立办公室、基础资料收集。（2）专题研究阶段。（3）编制规划阶段。（4）审查验收阶段。规划的主要内容：在研究《滨州市耕地总量动态平衡》《基本农田保护》《滨州市城镇土地利用问题》等5个专题的基础上，形成《滨州市土地利用总体规划》文本和说明，制定《滨州市土地利用总体规划图》《滨州市基本农田保护区图》等6种图件。2000年，该规划经山东省人民政府批复实施。2001年11月，对全区基本农田进行调整划定，将基本农田落实到具体地块，结合地籍图、分幅现状图制作形成全区基本农田保护区图，建立台账，将资料整理收集归档，统一制作保护标志30余块，公告牌13块，制定基本农田保护监督检查六项制度，上墙公告。2004年7月，按照省政府《开展全省基本农田保护检查工作的通知》，成立领导小组，组织专门工作班子和技术指导小组，对在检查中查出的问题进行整改，与各乡镇办补签“目标责任书”11份，乡镇办与村补签788份，做到面积落实，责任到人，保护到地块，作埋设保护牌50块，完善各种文件、方案、计划、规划台账和图件，形成一套完整的档案资料，并逐级备案。2005年，基本农田保护面积调整为50266.67公顷，保护率达84.8%。2007年，根据基本农田保护地块变动情况，增设铝合金保护牌10块，水泥保护牌10块。