1982年，财政机关设立监察科（股级），履行审计监督职责，实行“财审合一”的体制，只对财务收支情况进行审计监督。1984年6月，设立滨州市审计局，下设财政金融科、行政事业科、综合科、工交科、商贸科、内审科、办公室等科室，开展工交企业审计、商粮贸企业及行政事业单位等项审计。1987年，滨县审计局并入滨州市审计局，科室设置未作变动。1988年，设立审计事务所(副科级事业单位)。1999年，审计事务所成为自主经营、自负盈亏、自负民事及法律责任的独立法人单位，归属社会中介服务。2000年12月，滨州市审计局改称滨城区审计局。2001年3月28日，设立滨城区经济责任审计办公室（正科级），与审计局合署办公，下设经济责任审计科。2006年，设立基本建设审计中心，隶属滨城区审计局。2007年，滨城区审计局下设6科1室：行政事业科、财政金融科、经济责任审计科、经贸科、固定资产投资科、综合科、办公室；2个中心：农村财务审计中心、建设项目审计中心，分别行使各项审计职能。