1984年，滨州市开始在企业中推行以出售、租赁和兼并为主要模式的产权制度改革。1993年6月，滨州市塑料制品厂依法破产，这是滨州市首家破产企业，破产资产由滨州万隆化轻集团公司整体接收。1995年5月，滨州地毯厂资产整体出售，成为班子集体控股、企业法人持大股、职工自愿持股的非公有制企业。8月26日，滨州市染织厂依法破产。1996年5月21日滨州市锅炉厂依法破产。
1997年，企业改制继续深化，通过企业联合兼并、承包经营、资产交易等多种形式，建立以资产监管层—资产运营层—生产经营层为基本构架新的企业管理机制。区域经济形成以产权关系为纽带的法人治理机构。7月31日，滨州市织袜厂依法破产，职工由滨州针棉织品集团接收，实现资产重组。1998年6月15日，滨州市制革厂依法破产，资产由滨州黄河纸业集团收购，职工由黄河纸业集团安置。2000年3月28日，滨州市化肥厂依法破产，剩余资产待处理。12月20日，滨州市铸造厂依法破产，由滨州市特种合金有限公司整体收购滨州市铸造厂和铸锅厂。
2001年3月16日，滨州市滨北化工厂整体资产由滨州永振设备有限公司收购。6月7日，滨州市滨城区石油化工机械厂依法破产，职工由滨州市渤海石油机械有限公司接收。9月19日，滨州星岩动力机械有限公司依法破产，职工由滨州海力机械有限公司接收。2002年1月23日，滨州九环企业集团有限公司依法破产，职工由滨州九环机械有限公司接收。2月7日，滨州市滨翔针纺有限公司依法破产，职工由滨印集团安置。4月22日，滨州市酿酒厂依法破产，职工由滨鹏门窗有限公司接收。至2003年底，共组建7家企业集团，集团以控股、购股等方式构成。发展紧密层企业28家，半紧密层企业40余家。通过企业间的嫁接重组，达到资产组合和企业间的优势互补，充分发挥企业集团的产业、产品的技术优势，为中小企业的发展、实现规模效益走出了一条新路。通过破产拍卖、收购兼并、股份制改革、合资合作等产权变革的办法，稳步推进国企改革进程。山东亚光纺织集团，先后兼并收购滨州市油棉一厂、滨州市织袜厂。滨州市第五油棉厂转换内部经营机制，深化股份制改革，组建滨州市金源纺织有限公司。截至2004年底，区属23家企业已有20家全面完成改制，改制面87%，山东亚光纺织集团、滨州市特种合金厂、滨州市轻工机械厂国有资产全面退出；依法破产企业4家，甩掉债务2亿元，盘活不良资产近亿元。2005年，第二化工有限公司依法破产，为盘活企业资产，新成立滨州双信化工有限公司。滨州机械厂依法破产，成立滨州百斯特纺织有限公司。小营制药厂由山东科伦药业有限公司依法收购，妥善安置企业下岗职工，并实现产量翻番。滨州市塑料彩印厂采取职工入股形式，成立滨州市环海活塞有限公司。2007年，滨城区加快推进区属国有企业改革，滨州第三棉纺厂、滨州黄河纸业集团、春晓集团、万隆化轻有限公司、滨州市服装厂、第二化工厂、滨州新华印刷厂７家困难企业结合各自实际，依法稳步推进企业破产和改制工作。