化学工业是滨州市的新兴产业。1982年建市后，境域内有惠民地区所属企业2家，即滨州化工厂和渤海化肥厂。1985年，耿家居委会在滨州化工厂的协助下办起1处小化工厂，生产固体碱、乳化油等5种产品。固体碱质量好，年生产量500吨。1987年滨县并入滨州市后，原滨县化肥厂和滨县磷肥厂归属滨州市，分别改称滨州市化肥厂和滨州市第二化工厂。1990年，乡镇企业中化工企业有11处。1993年，滨州市农药厂投产，主要生产乙草胺。滨州侨昌农药厂建成投产，主要生产除草净。2006年，已有注册生物化工企业58家，总资产6.5亿元，年销售收入15亿元，占全区GDP13%，其中，规模以上企业23家，资产6.2亿元，年销售收入13.7亿元。
2007年，山东侨昌化学有限公司投资7054万元、年产5000吨的除草剂项目属高新技术项目，技术属国内首创；投资1578万元的异丙甲草胺技改与污水处理10月份投入使用；投资4458万元、年产3000吨原药中间体草甘膦、1500吨莠去津项目11月完成投入生产。山东滨州新天阳化工有限责任公司、裕华化工厂甲醇、二甲醚项目投产。滨州市瓯达工贸有限公司、滨州市民众生物燃料有限责任公司等年底达到批量生产能力。年内新建化工企业有滨州市华创化工有限责任公司、明宇精细化工公司、滨州市弘旭精细化工有限公司、滨州玉成化工有限公司、德润科技公司、百盛化工公司、丰华橡胶粉有限公司、远洋塑胶工业公司、滨州市东坤科技有限公司、滨州市民众生物燃料有限公司、鑫磊化工有限公司等。年底境内有注册化工生物企业61家，其中规模以上企业23家，实现总产值44.1亿元。产品涉及石油化工、化学制成品、塑料、农药医药、生物制品、生物能源、有机化肥等。
山东侨昌化学有限公司
始建于1993年，位于黄河二路713号，注册资金1亿元，固定资产2.3亿元。职工860人，主要生产乙草胺、玉草净等产品，是国家定点的农药生产企业，集科、工、贸于一体的大型农用化工集团。公司以科技为先导，每年拿出销售收入的10%投入到高科技产品研发上，投巨资在上海建立中科侨昌农药创制中心。该中心创制的产品并已取得国际专利的高效油菜田除草剂已推广20余公顷，新创制的具有自主知识产权的高效水稻田、玉米田除草剂已进行农药登记。在山东滨州、邹平、沾化、江苏徐州、吉林四平建立了化工中间体和原药生产基地。原药品种有酰胺类、三氮苯类、嘧啶类、磺酰尿类、苯氧羧酸类等20多个，年生产能力达6万吨。制剂有80多个品种，280多个规格，年生产能力达5万吨。生产规模在国内除草剂企业位居第二位。在世界30多个国家和地区进行农药注册登记和销售，已成为农药出口创汇大户。公司销售额每年以25%的速度增长，跨入高科技大型农化集团行列。2005年，“QC”图案获“山东省著名商标”荣誉，10%的丙酯草醚获“国家重点新产品”称号，“苗友”牌42%甲草乙莠获“山东名牌”等称号；2006年，侨昌牌玉草净获“山东名牌产品”称号，公司获“民营科技企业”等称号。公司通过ISO9001∶2000质量管理体系认证，为市级企业技术中心、省级高新技术企业。2007年，公司实现主营业务收入7.03亿元，利税7500万元，缴纳税金2520万元，其中上交地方财政173.6万元。
山东滨州天阳化工有限责任公司
原名滨南化肥厂，2002年依法改制，注册登记为民营企业。位于滨州市黄河五路与十二路之间，紧靠渤海二十路的滨州市经济开发区中心。注册资金223万元，固定资产1599万元，职工390人。主要产品有：以天然气为原料生产农用碳铵、工业甲醇和高活性酒用酵母及面包酵母。2003年，通过强化内部管理和技术改造，实现工业总产值 5805万元，销售收入5464万元，利税1157万元。2006年获“执行劳动法律法规十佳单位”、“发展民营先进企业”等荣誉称号，并被评为市级信用民营企业。2007年，投资3.85亿元，新上年产6万吨甲醇、10万吨二甲醚新项目。实现主营业务收入5095万元，利税848万元，缴纳税金506万元，其中上缴地方财政255.2万元。
安琪酵母（滨州）有限公司
1999年成立，位于滨北办事处永莘路139号，注册资金9600万元，固定资产9578万元，职工110人，主要生产鲜酵母。2006年“安琪”酵母获“山东名牌产品”称号，2005、2006年连续被评为“A级纳税企业”。通过ISO9001质量管理认证，为市级企业技术中心、省级高新技术企业。2007年实现主营业务收入4604万元，利税1447万元，缴纳税金512万元，其中上缴地方财政208.35万元。
山东滨州滨农科技有限公司
始建于1995年，系山东省高新技术企业，拥有自营进出口权。位于滨州市工业经济开发区，紧邻205国道，新永莘路518号。注册资金6000万元，固定资产5600万元。占地40公顷，员工2000人，主要生产微乳剂、水乳剂、水剂、乳油、悬浮剂、悬乳剂、可湿性粉剂、水分散粒剂等60多个品种，年总产量2万吨。公司先后通过ISO9001质量管理、ISO14000环境管理、OHSAS18000职业健康安全管理认证。为市级企业技术中心、省级高新技术企业。2007年公司实现主营业务收入11.57亿元，利税5095.17万元，上缴地方财政243.17万元。
惠友化工厂
1996年，北镇办事处五四三居委会投资50万元创建惠友化工厂，主要生产纺织助剂、印染助剂、油田助剂、防腐涂料、氯化聚乙烯等系列产品。厂区建筑面积1353.30平方米，有标准车间、库房、化验室，各种设备、仪器一应俱全，年产各种油田化工助剂过万吨，年创利税50多万元，常年供应油田各矿区使用，并远销天津、淄博、潍坊及西班牙、泰国、俄罗斯等20多个国家和地区。2007年实现销售收入2000万元，利税200万元。
山东滨化东瑞化工有限责任公司
山东滨化东瑞化工有限责任公司是山东滨化集团有限责任公司下属的控股子公司，是一家新建高新技术企业，对建设项目从工艺设计上、设备选型上着重突出了循环经济、节能经济、安全和环保的要求。项目总投资16亿元，占地56公顷。工程于2007年5月破土动工，设计建设25万吨/年离子膜烧碱装置、10万吨/年粒碱装置、4万吨/年三氯乙烯装置、12万吨/年氯乙烯装置、15万吨聚氯乙烯装置、6万吨环氧丙烷装置和年产1.6亿块新型墙体材料项目。预计2008年9月完工投产运营，全部投产后可实现年销售收入28亿元，利税5亿元，税收2.5亿元。