【机构设置】 区环境保护局（简称区环保局）为区政府环境保护行政主管部门。年末，内设办公室、财务科、污染防治科（挂行政审批科牌子）、宣传法制科4个行政科室。辖设污染物排放总量控制办公室、区环境监察大队、南海新区环境保护服务中心、区环境监测站4个副科级事业单位，共有工作人员58人。
【建设项目管理】 2016年，区环保局严格依法行政，严格遵守法律、法规、标准和生态保护的“红线”，规范开展建设项目环评审批，加强环境影响评价审批服务与管理，有效提升项目环评审批效率和把关审批的质量。全年审批建设项目192个、验收建设项目45个，建设项目“三同时”（建设项目中污染防治设施必须与主体工程同时设计、同时施工、同时投产使用）执行率达到100%，全年共否决不符合产业政策、环保政策和高污染高耗能的项目10项。根据《山东省清理整顿环保违规建设项目工作方案》（鲁政字[2015]170号）文件要求，区环保局将违规建设项目纳入文登区环保局的正常监管范围。其中依法淘汰不符合产业政策或污染严重且治理无望违规建设项目5项，依法对完成整改任务的3个项目予以环保备案。
【环境监察】 2016年，区环保局按照《山东省环境保护大检查实施方案》有关要求，贯彻“全覆盖、零容忍、明责任、严执法、重实效”的总体方针，明确检查实施方案的重点内容，采取部门协同、联动执法、独立调查等方式，对重金属污染物排放企业、污染减排重点企业、超标排污企业、危险废物监管、化学品（危险化学品）监管、废旧塑料加工摊点、鱼粉生产企业、液氨制冷企业、小铸造企业、石材加工行业等进行专项整治。重点加强对全区32处威海市控以上重点污染源的日常监管，提高监察频次，保证达标排放。8家国控、9家省控重点污染源外排废水、废气全部达标，无1家被省、市环保部门通报批评。是年，共出动现场执法人员8673人次，立案查处3家企业，责令限期整改7家企业，依法将3家企业移送公安机关，予以行政拘留2人，刑事拘留2人。
环境网格化监管 2016年1月1日，全区网格化环境监管体系正式实施，区网格化环境监管体系以文登区行政区域为单元设立一级网格，各镇（办事处、开发区、管委）、相关部门为单元设为二级网格（共50个），各行政村（居委会、社区企业）为单元设为三级网格（共771个）。区环保局对网格化环境监管体系内的点位进行编码，科学统筹管理，并在政府网站进行公开。
环境行政处罚 是年，区环保局对14家企业（个人）因未批先建、外排废水超标、外排废气超标等引发的15起违法案件立案查处，共处罚金144万元。
环境信访处理 2016年，区环保局继续完善12369环境信访热线等信访投诉渠道，征求群众对环保工作的意见和建议，协调公安、工商等部门开展联合执法工作，及时处理群众关心的环境热点、难点问题。全年共处理信访件753件，其中区长公开电话受理事项批办单588件、12369投诉165件、接待来访群众9人次，处结率达100%，群众满意率达99%以上。
【排污费征收与使用】 2016年，区环保局严格执行《排污费征收使用管理条例》及配套规定，在全面开展排放污染物申报登记的基础上，按照核收分离、票款分离、公开公正、依法足额征收的原则，共征收排污费610.4万元，按规定解缴各级财政，实行专款专用。
【环境宣传】 2016年，区环保局开展中小学环境保护宣传教育，贯彻环保教育“从娃娃抓起”的思想，通过多形式、多渠道的宣传，进一步提高中、小学生的生态文明理念。“六·五”世界环境日在金都广场悬挂宣传横幅、设置拱门、展设环保宣传刊板等，发放环保宣传资料、环保知识手册，进行环保、低碳、绿色生活等宣传，收到良好宣传效果。
【环境信用评价和红黑榜评选】 根据《关于印发<威海市企业环境信用评价管理办法（试行）>的通知》(威环发〔2014〕115号)、《关于印发<威海市企业环境信用评价指标及评分办法>的通知》（威环发〔2015〕34号）等文件规定，文登区共有40家企业被纳入环境信用评价范围。2016年，区环保局根据标准进行评分后，确定27家环保诚信企业、9家环保良好企业、4家环保警示企业，无环保不良企业。按照《威海市企业环境信用“红黑榜”管理制度（试行）》的要求，区环保局对全区所有工业企业单位、三产服务业、农业服务和个体工商户等进行评价，每季度发布1次，环境信用按照评价单位环境行为分为“红榜”和“黑榜”，是年，文登区有1家企业被列入红榜，10家企业被列入黑榜。
【清洁生产审核】 2016年，根据省环境保护厅《关于下达2016年度全省实施清洁生产审核重点企业名单的通知》的有关要求，全区共有8家企业需完成清洁生产审核验收，分别为威海文隆电池有限公司、威海岱韩特殊金属有限公司、文登市森鹿制革有限公司、文登威力工具集团有限公司、文登市广润金属制品有限公司、文登市大方水泥有限公司、山东省好当家海洋发展股份有限公司荣泰食品厂和文登创业水务有限公司。年末， 8家企业均完成清洁生产审核报告编制工作，并向威海市环保局提交验收申请。