2003年，地方药品监督机构经费上划省级管理，上划经费基数37万元。住房公积金管理机构经费上划泰安管理，上划经费基数10万元。企业所得税分享比例由2002年中央、省、泰安市、肥城市50%、10%、10%、30%，调整为60%、8%、8%、24%；个人所得税分享比例由2002年中央、肥城市各50%，调整为60%和40%。成立会计集中结算中心，53个市直行政事业单位纳入会计集中结算范围。改革粮食风险基金管理办法，补贴重点转向销售环节，全年节约财政补贴480万元，消化处理老库存粮食4200万公斤。城建资金管理实行工程项目预决算管理制度。公费医疗管理实行基本医疗保险制度。2004年，取消农业特产税，降低农业税率3个百分点，转移支付补助资金5839万元。报关出口货物退付增值税，退税基数部分退税额由中央财政负担，超基数部分中央和地方按75∶25比例分担。出口退税按分享比例由中央和地方退库。地方负担的企业退税额由市、县（市、区）负担，核定出口退税基数3910万元，基数返还978万元。市直行政事业单位工程项目建设资金实行市长审批或财政部门备案制度。2005年，农业税率再降低2个百分点，转移支付补助资金1189万元。省级储蓄存款利息个人所得税下划市县，与原属泰安市以下个人所得税一并参与分享。调整个人所得税分享比例为中央60%、省级15%、县（市区）25%。煤炭资源税实行市级按比例分成办法，市级固定分成比例30%，年终按各县（市区）煤炭资源税入库金额结算，专项上解市财政。烟草分公司实现的增值税、企业所得税及城市维护建设税、教育附加，实行泰安市级分公司统一纳税，核定上划烟草收入财力补助基数190万元。调整中央与地方出口退税分担比例，超基数部分中央与地方按照92.5∶7.5比例共同负担，出口退税由中央统一退库，取消中央对地方的出口退税基数返还，地方负担部分年终专项上解。归并对泰安定额结算项目定额结算1868万元、地方税务经费493万元、技术监督局经费61万元、药品监督机构经费37万元、住房公积金管理机构经费10万元、永春堂药店汇缴增值税结算7万元，归并后定额结算上解2462万元。2006年，原体制上解递增比例由5%调整为3%，2005年原体制上解4312万元。取消农业税，转移支付补助资金474万元，国有农场税费改革转移支付资金21万元。全市每年农村税费改革转移支付基数9483万元。出口退税地方负担比上年增加部分，省财政负担1／4。同年7月，调整机关事业单位工资，增加离退休人员离退休费，转移支付1215万元。之后，每年2430万元。市级
73个预算部门（单位）实现网上申报、网上支付、网上核算。2007年，对原属省级收入范围的发电企业及2007年1月1日后新注册、投产的火力发电企业，实行增值税和企业所得税地方分成部分由省市按6∶4比例分成（增值税按15%：10%、企业所得税按24%：16%），下划税收上解基数3070万元。同年8月，市财政补贴农村党组织书记每人每月200元。12月，乡镇教师工资上划市级管理。