2003年，国家庄煤矿、大封煤矿进入破产程序，宏达公司、多种经营公司合并至鲁泰工程公司，第二医院合并至中心医院，机关小学合并至公司中学。民营化改革试点取得成功。白庄矿线缆厂、陶阳矿拔丝镀锌厂和高余焊接材料公司改制为民营企业。推行工资集体协商制度、物业管理制度和医疗制度等项改革，先后有6名政绩平庸的矿处级干部予以免职或解聘。2004年，加大产权制度改革力度，投资1577万元控股肥城弘德建材公司，为进入石膏建材行业奠定基础。大封矿、国庄矿破产立项获批。在干部任用上实行竞聘制、试用期制、任前公示制，坚持年度考核制、离任审计制、戒免制等制度；在用工制度上采取多种用工形式并存，全部合同化管理；在分配制度上，坚持和完善效益工资制，并进行工资集体协商制度试点。年内，集团公司推行工资集体协商制度的经验在全省推广。2006年，在全省省管企业中率先完成主辅分离辅业改制工作，13个改制单位4983名职工完成身份转换。陶阳、查庄两矿关闭破产，国务院已批准立项，并列为首批实施破产的矿井；平铝重组圆满结束，2197名职工妥善分流安置。2007年，杨庄矿完成破产重组，陶阳、查庄两矿进入破产法律程序，4410人办理内部退休退养，中央财政下拨资金10多亿元。集团公司通过5个矿井关破，累计提前退休退养8470多人，中央财政补助资金超过19亿元。