2007年，全市农业总产值501493万元。其中，种植业产值347664万元、林业产值13095万元、牧业产值123662万元、渔业产值1739万元、农林牧渔服务业产值15333万元。各业产值占农业总产值的比例分别由2002年的62.92%、1.97%、34.74%、0.37%，调整为69.33%、2.61%、24.66%、0.35%、3.06%。
1、种植业结构调整。2007年，全市农作物总播种面积118338公顷，其中粮食作物播种面积80474公顷，油料作物播种面积2287公顷，棉花播种面积1335公顷，瓜菜类播种面积33190公顷，其他作物播种面积1052公顷。各种作物播种面积占农作物总播种面积的比例分别由2002年的70.8%、2.1%、0.74%、25.11%、1.25%调整为68%、1.93%、1.13%、28.05%、0.89%。全市38000余公顷小麦生产基本实现由传统品种向优质专用小麦品种的转换，以“马铃薯/春玉米—秋菜”为种植模式的“两菜一粮”种植面积达到7000余公顷，成为特色种植模式，有机蔬菜种植面积由2002年的2000公顷增加到2007年的10400公顷，成为全国县级区域有机蔬菜种植面积最大的县。
2、林业结构调整。2003～2007年，全市实施荒山绿化、农田林网、绿色通道、速生丰产林、经济林开发、林业育苗“六大”重点建设工程。累计荒山造林3300多公顷，栽植各类荒山绿化苗木1000多万棵，林网化面积53330余公顷，建设绿色通道600公里，栽植速生杨树200万棵。北部矿区塌陷地和南部沿汶河河滩地，发展速生丰产林5330余公顷，用材林基地总面积6660余公顷。中部山区集中发展优质桃系列品种，形成具有一定规模特色的优质肥城桃生产基地，面积6660余公顷。南北部山区大力发展核桃、樱桃、李子等干鲜果品，形成6660余公顷具有区域特色的经济林开发片。以汶阳镇为重点的林业育苗面积达到2000公顷，各类苗木花卉产值8000万元。
3、畜牧业结构调整。2003～2007年，以生猪、商品鸡、奶牛三大主导产业为重点，发展食草、节粮、高效畜禽。一是在稳定猪、鸡传统生产项目的前提下，加快发展肉牛、肉羊和特种动物养殖。2007年，全市节粮、食草畜禽占社会饲养量的52％，奶牛存栏2.5万头，比2002年增长200倍。二是坚持引进、繁育、推广相结合的方针，改良畜禽品种，提高良种比例。全市建立14处奶牛改良站，老城、湖屯建立2处生猪人工授精站点，肉猪生产中三元杂交瘦肉型猪占85％，肉牛、肉羊改良率分别达到66％和40％，蛋鸡、肉鸡的良种率达到98％以上。三是依托银宝、八戒、永大畜产品加工企业，调整畜产品结构。猪肉占肉类总产量的比重下降到60％，牛羊禽兔等肉类达到40％以上，奶产量6.3万吨，比2002年增长147倍。四是发展规模饲养，调整区域布局。涌现出一批发挥资源和区位优势，发展主导产业和主导产品的畜牧专业村和基地。其中北部乡镇的奶牛基地，潮泉、边院的蛋鸡生产基地，王瓜店、安驾庄和汶阳肉鸡、肉鸭生产基地，石横、湖屯的生猪生产基地，王庄、桃园的肉牛生产基地已基本形成。