5年间，完成各类专项资金审计项目17项。2003年，开展了公安系统财政收支审计、工商行政管理系统审计和审计调查、农业与资源专项资金审计及社会保障资金审计、非典型肺炎专项资金审计和社会捐赠款物审计、总工会财务收支审计。2004年，开展了科技三项经费审计调查、外贸发展基金专项审计调查、水利资金行业审计、最低生活保障资金审计、农村公路改造工程项目审计、国有企业财务清理审计、扶贫资金审计、盐业资金审计。2005年，开展了食品、药品监督系统审计和审计调查、水资源费专项审计、职工基本养老保险基金审计、医院收费项目审计、污水处理费和排污费审计调查、新华书店财务收支审计。2006年，开展了新泰市第二批三峡移民资金的审计、建筑企业养老保障基金审计、邮政系统财务收支审计、法院系统诉讼费专项审计。2007年，开展了慈善资金专项审计、村村通自来水工程建设项目审计和效益审计调查、新型农村合作医疗基金专项审计。专项资金的审计规范了资金收支管理，查出了存在的问题。