2003～2007年，全市工商行政管理各项工作进入快速发展阶段，市工商局大力培育和建设社会主义市场体系，管理职能不断扩展，管理业务不断延伸，到2007年底，管理业务包括市场管理，登记注册管理，合同管理，商标管理，广告管理，经济监督管理等。工商局内设7个科室、2个直属局，下设16个基层工商所。共有工作人员401人，其中硕士研究生1人，本科生30人，专科毕业生159人。5年间两次对基层工商所进行重建和改造，交通工具几经更新，各所开通网络传输，实现无纸化办公。2005年，市局新办公大楼开工建设，2006年9月，建成启用，共10层，建筑面积8716平方米，占地面积22670平方米，设有注册大厅、12315申诉举报中心等办公场所和文化展室、翰墨展厅、阅览室等宣传教育基地，达到了规范化、信息化、现代化的要求。同时建成投入使用的还有位于商场北门1000多平方米的商品质量检测中心，中心可以对食品、建材、农资、农副产品等9大类200余个品种实施质量检测。
2004年，市工商局被肥城市委、市政府授予“服务地方经济发展十佳单位”。2005年，被省工商局、省人事厅授予“先进集体”称号。2007年，被省文明委授予省级“文明单位”称号。据不完全统计，工商局受上级党委、政府和上级局表彰奖励70余次，个人受表彰300余人次。