东平县药品监督管理局于2002年4月组建， 7月5日挂牌办公，为行政执法单位， 编制17人。下设办公室、监督科、稽查队。同年10月，县药品检验所整建制划归县药监局，由差额单位变为财政全额事业单位，为药监局的直属机构，编制8人，实有7人。2003年7月起，实行省以下药品监督管理系统垂直管理。县药监局的领导干部实行市县双重管理，以市药监局党组管理为主。资产和经费由省财政统一管理，罚没收入经当地代收网点上缴省级国库。至2003年12月， 县药监局共有干部职工18人，其中局长1人，副局长2人， 干部9人，工勤人员2人。