全县有县级医疗机构4处，乡镇医疗卫生机构16处，厂企及私营医疗卫生机构4处，乡村卫生室（所）526处。
一、东平县级医疗机构
东平县第一人民医院 院址州城镇，占地面积3.8万平方米，建筑面积2.68万平方米。2003年有固定资产1600万元，职工274人，其中副主任医师以上21人。系二级乙等医院。
东平县人民医院 院址县城东山路西，占地面积3.5万平方米，建筑面积3.2万平方米。2003年有固定资产6600万元，职工416人，其中副主任医师以上56人。系二级甲等医院。
东平县中医院 院址县城佛山街北，占地面积3万平方米，建筑面积1.3万平方米。2003年有固定资产1300万元，职工161人，其中副主任医师以上8人。
东平县第三人民医院 院址东平县城西42公里处的戴庙乡政府驻地，占地面积1.73万平方米，建筑面积6786平方米。2003年有固定资产371.5万元，职工80人，其中副主任医师1人。系一级甲等医院。
二、东平县乡镇医疗卫生机构
东平镇卫生院 院址县城清河街东首，占地面积2600平方米，建筑面积700平方米。2003年有固定资产130万元，职工42人，其中主治医师3人，主管药师1人，会计师1人。系一级乙等医院。
宿城卫生院 院址东平镇宿城村，占地面积7200平方米，建筑面积2720平方米。2003年有固定资产170万元，职工72人，其中主治医师13人。系一级乙等医院。
水河中心卫生院 院址老湖镇上水河村，占地面积14000平方米，建筑面积4240平方米。2003年有固定资产72万元，职工67人，其中副主任医师1人，主治医师14人。系一级甲等医院。
州城卫生院 院址州城，占地面积6752平方米，建筑面积3571平方米。2003年有固定资产41万元，职工63人，其中主治医师19人，系一级乙等医院。
新湖卫生院 院址新湖乡政府驻地，占地面积8858平方米，建筑面积3500平方米，2003年有固定资产43.1万元，职工42人，其中主治医师5人，系一级乙等医院。
沙河站中心卫生院 院址沙河站镇政府驻地，占地面积1.5万平方米，建筑面积5103平方米。2003年有固定资产85.11万元，职工50人，其中副主任医师2人，主治医师12人。系一级甲等医院。
彭集卫生院 院址彭集镇政府驻地，占地面积1.7万平方米，建筑面积5100平方米。2003年有固定资产150万元，职工95人，其中副主任医师1人，主治医师21人。系一级甲等医院。
接山卫生院 院址接山乡政府驻地，占地面积1.67万平方米，建筑面积3503平方米。2003年有固定资产120万元，职工62人，其中主治医师15人，系一级甲等医院。
张河桥卫生院 院址接山乡张河桥村，占地面积8800平方米，建筑面积1600平方米。2003年有固定资产25万元，职工30人，其中主治医师5人，系一级乙等医院。
大羊卫生院 院址大羊乡政府驻地，占地面积1.3万平方米，建筑面积2500平方米。2003年有固定资产146.6万元，职工50人，其中主治医师6人，系一级乙等医院。
梯门卫生院 院址梯门乡政府驻地，占地面积15846平方米，建筑面积3608平方米。2003年有固定资产102万元，职工57人，其中主治医师12人。系一级甲等医院。
老湖中心卫生院 院址老湖镇政府驻地黄花园村，占地面积15384平方米，建筑面积4027平方米。2003年有固定资产250万元，职工76人，其中主治医师3人，系一级乙等医院。
旧县卫生院 院址旧县乡政府驻地，占地面积7289平方米，建筑面积2647平方米。2003年有固定资产70万元，职工26人，其中主治医师11人，系一级乙等医院。
斑鸠店卫生院 院址斑鸠店镇政府驻地，占地面积1.6万平方米，建筑面积4582平方米。2003年有固定资产210.8万元，职工60人，其中副主任医师3人，主治医师16人，系一级乙等医院。
银山中心卫生院 院址银山镇政府驻地，占地面积1.2万平方米，建筑面积6519平方米。2003年有固定资产310万元，职工90人，其中副主任医师1人，主治医师30人，系一级乙等医院。
商老庄卫生院 院址商老庄乡政府驻地，占地面积4043平方米，建筑面积1156平方米。2003年有固定资产21.6万元，职工33人，其中副主任医师1人，主治医师3人。系一级乙等医院。
三、私营医疗卫生机构
泰美宝法肿瘤医院 1996年5月筹建，1988年3月试营业，1999年8月由泰安市卫生局发放许可证，至2002年12月，联合另外四家企业成立山东宝法医疗科技股份公司泰美宝法肿瘤医院。院址东平县城稻香街西首，占地面积4.66万平方米，建筑面积1.5万平方米。2003年有固定资产5000余万元，职工80人，其中副主任医师7人，拥有国际先进的的医疗器械设施，推行国际领先的医学理论及疗法，系整体实力国内领先的特色专科医院。
四、其他医疗机构
山东黄河建材局职工医院、山东瑞星化工集团公司职工卫生院、东平县交通职工医院。
五、村卫生室（所）
全县共有村级卫生室（所）526处，从业人员1326人。