1985年，县人民武装部属军队建制，配部长、副部长，政委、副政委，下设政工、作训动员、供管3个科室。1986年4月，县人民武装部改归地方建制，设部长、政委，下设军事科、政工科、办公室3个科室。1988年，增配副部长（副政委），增设后勤科。1996年4月至2002年，县人民武装部收归军队建制，配部长、政委、副部长，下设军事、政工、后勤3个科室。1996年，县人武部收归部队建制后，县委常委每年一般举行一至二次县委常委议军会议，主要解决全县武装工作的重大事项。1985年至1996年，县人民武装部部长参加县委常委，1997年至2003年县人民武装部政委参加县委常委。1985年至2003年，县设立人民武装委员会，主要由县委、县政府主要领导、县直部门有关负责人和县武装部有关领导组成。主要研究决定有关人民武装工作重大事情。1986年至2003年，中共东平县委书记兼任县人民武装部党委第一书记，保证党对军队的绝对领导。