监所科负责对看守所的活动是否合法及超期羁押进行监督，办理刑罚执行和监督改造活动中发生的贪污、贿赂、侵权、渎职等案件的侦查工作，被监管改造人员重新犯罪案件的批捕起诉工作，受理被监管改造人员控告、申诉工作。1986年至2003年，配合严厉打击危害社会治安的刑事犯罪斗争，加强对看守所管理活动的监督，定期由公安局长、检察长和法院院长轮流对在押人犯进行法制教育、政策教育、道德教育和前途教育，不定期的找在押人犯谈话，促使在押人犯认罪、服法和检举、揭发，立功赎罪。1986年至2003年，共上法制课143次，谈话1004人次，清狱139次，办理申诉案件8件，纠正违法184件，对外执犯考查11人次。