1979年恢复县委统战部。1988年7月设立县委对台工作办公室，隶属县委统战部。1991年6月改称县委台湾工作办公室，与县委统战部合署分设，列县委序列。1993年11月，与县委统战部合署办公（保留县委台湾工作办公室的牌子）。县民族宗教办公室于1993年8月划入县委统战部，2002年5月划出，隶属县政府办公室，业务工作由县委统战部负责指导。
一、服务经济
1996年以来，配合山东省民委在东平县实施“鲁羊扶贫”工程，从上级部门争取资金600多万元，用于收购小尾寒羊。全县55个少数民族村的回汉群众从中受益，小尾寒羊养殖业得到发展。至2003年底，小尾寒羊存栏量45万只，年外调良种6万只。在特色经济具有一定规模的乡镇成立行业商会。在非公有制经济人士中开展“争当社会主义事业优秀建设者”活动，引导统一战线成员为社会多做贡献。
二、统战宣传
1986年以来，统战宣传工作，不断拓宽渠道，实现由内部宣传向社会宣传转变。每逢党中央及上级党委召开重要会议，及时组织统战干部、党外代表人士、工商联（商会）人士、台联、侨联等统一战线成员学习会议精神，进行专题讨论，开展学习经验交流活动。定期举办统战成员座谈会，每年国庆节、元旦，1997年香港回归、1999年澳门回归前夕，组织统战专题茶话会、座谈会，开展爱国主义教育。开展统战政策培训，1990年以后举办了5期统一战线知识政策培训班，参训人员280人。及时向上级部门报送信息，反映基层统战情况。止2003年，向上级部门年平均报送统战信息30篇，省级刊物刊登稿件10篇。
三、民主党派工作
县内有中国国民党革命委员会成员2名，中国农工党党员1名。
四、党外干部和非党知识分子工作
1989年，县委组织部、统战部制定《关于培养选拔党外干部的工作规划》，重点掌握100名党外干部情况。2000年7月、2001年8月、2003年11月三批选送9名党外后备干部参加全市党外中青年干部培训班。2002年县人大、县政府、县政协领导班子中安排副县以上党外干部5名，其中2名为民主党派成员。2002年，全县共有初级以上职称和中专学历以上的非党知识分子7169名。是年9月，对社会中介组织非党知识分子情况进行调查，培养确定了3名非党知识分子代表人物。2003年1月，县十五届人大一次会议上，出席会议的有76名党外人士当选为人大代表。县政协六届委员中，党外人士151名，占61%，其中21名为县政协常委。
五、民族工作
全县共有18个少数民族，分布在州城、老湖、戴庙、大羊、东平镇等乡镇和县直企、事业单位。1990年以来，制定了《关于加强民族工作的意见》等文件，建立了县六大班子民族工作包村联系点制度。2002年以来，共完成15个帮扶项目。其中为州城镇西门村、新湖乡西王庄村、老湖镇展庄村、西一村等民族村各建筑1条公路，总投资130万元。为三个民族村架设自来水管道，投资30万元。帮助4个民族村上了特种动物养殖、林果、渔业等项目，总投资48万元。2003年8月，制定 《东平县培养选拔少数民族干部工作的四年规划及实施意见》。县六届政协委员中少数民族委员12名，占委员总数的4.8%。
六、宗教工作
全县有天主教、基督教、伊斯兰教、道教、佛教等5种宗教。信教群众分布在14个乡镇的320个自然村。1995年以来，经县政府依法登记正式批准的宗教活动场所17处，宗教教职人员4人。其中天主教活动场所7处；基督教活动场所9处，伊斯兰清真寺1处。1999年12月，成立“东平县天主教爱国会”组织，在信教群众中开展精神文明活动。
2000年至2003年，逐步加强和完善对宗教活动的管理，建立健全县乡村三级宗教管理网络，制定了《宗教活动场所管理暂行规定》、《信教群众爱国爱教公约》，贯彻“自治、自传、自养”的“三自”方针，依法进行对宗教活动场所的年检工作。
七、对台工作
全县共有去台人员341人，东平籍台胞1800人，台属909户、6450人。1989年4月召开全县第一次台胞、台属代表会议，选举产生了第一届台胞、台属联谊会，在台办指导下，做好对台工作。
1986年，台胞首次回东平探亲，是年接待1人。1988年，共接待探亲台胞38起58人。2003年底累计接待台胞472人次。1986年，县内台属首次赴香港会亲，有3起4人。1988年共有13起18人赴香港会亲。2003年底，赴港会亲、赴台探亲、考察累计达到25起36人次。1983年，台属首例赴台定居。至2003年累计赴台定居6人。1989年第一次安置台胞定居，至2003年共安置定居3户3人。
1987年后为东平去台人员与亲人沟通联系，促进东、台之间的人员往来。1995年、2001年分别成功接待台湾长乐传播公司《万里江山—大陆传奇》节目摄制组和台北市梁氏亲会参观访问团，共计22人。1988年至2003年，共接待台经贸考察团16个，182人次。1993年12月，全县第一家台资企业“东台荣华酒楼”正式注册。2003年有台胞投资企业2家，投资总额30万美元，实际利用台资70万美元。
1993年8月，县内首次出现涉台婚姻1例，至2003年底，全县共办理涉台婚姻4人。
1987年至1989年，集中开展落实台属政策工作。全县去台人员亲属中有政策问题的63起，至1992年，全部得到落实。处理家庭纠纷105起。其中处理台胞婚姻问题的做法，1988年得到中央对台领导小组办公室的肯定，并在《对台工作简讯》第8期上发表。有18名台属被选为县政协委员。
1990年，组织开展台属勤劳致富活动，2003年，全县共发展台属企业、个体工商户、专业户等共26个，投资总额380万元，其中利用台资260万元，就业人数310人，年营业额超过万元的10家，其中利润超10万元的3家。