1994年以前，税收征管模式一直沿用传统的税务专管员征管办法，即企业实行一人进厂，各税统管；农村个体业户实行划片分段，核定征收；集贸市场实行查验征收。对纳税人的所有涉税事宜都通过税务专管员办理。
1994年8月，机构分设后，国税局按照国家税务总局的要求，对征管模式进行多次改革，主要实行征管、稽查两分离，征收、管理、稽查三分离的办法，逐步取消传统管理模式；对个体业户仍继续实行定期定额的双定征收办法。
1996年6月，随着征收机构的改革，推行“以纳税申报和优化服务为基础，以计算机网络为依托，集中征收，重点稽查”的新的征管模式，建立纳税人自行申报纳税制度，以计算机为依托的税收监控体系，人机相结合的稽查体系，以及征管功能设置机构和划分职责的组织体系。
2001年7月，新的征管软件CTAIS（中国税收征管信息系统）正式运行，税收征管模式实现质的飞跃，纳税人涉税事宜全部通过计算机完成，彻底取消人工管理模式。同时，依托计算机网络，实行因特网、电话申报，邮政、银行网点代征，形成多元化申报格局，提高了工作效率。
2003年，实行“一窗式”管理，纳税人办理涉税事宜，只要到办税服务厅任何一个窗口，都能全部完成，办税程序更加快捷高效。
1994?2003年企业及个体业户情况表
单位：户
年度
1994
1995
1996
1997
1998
1999
2000
2001
2002
2003
企业
377
387
379
281
293
301
313
306
297
318
个体业户
4986
4137
4199
4207
4275
4163
4351
3968
4181
4212