1984年，设水土保持办公室，副科级事业单位，1993年撤销。1984年二十里铺电灌站，改称引湖电灌管理总站。1991年4月，升格为副科级事业单位，1993年11月，定为差额事业单位，有干部职工78人。1985年水利运输队与无盐电灌站合并。1987年5月，打井队、水泥制管厂合并，改称水利开发服务公司，1993年11月，定为企业化管理事业单位，共有干部职工58人。1992年6月，设水利物资服务站，为自收自支事业单位，共有干部职工36人; 同年，设水利建筑安装公司，企业化管理事业单位，共有干部职工27人。设东平湖引黄灌溉管理处，副科级自收自支事业单位，干部职工7人。1993年11月，无盐电灌管理站定为差额事业单位，干部职工33人。同年11月，设农田水利站、水资源管理办公室、水利勘测设计室。王台排涝站改名稻屯洼排涝站，定为差额事业单位，干部职工4人。1995年6月，增设科技科。1997年2月，增设抗旱服务队，与水利物资服务站合署办公，增设水土保持监察管理站， 同年10月，设水行政监察大队。至2003年，水利局下属6个事业单位、2个经济实体、5个事业科室（设计室与农水站合署，水土保持监察管理站与水土保持办公室合署，科技科与防汛抗旱指挥部办公室合署）。共有在职干部职工300人。