【水资源】 境内水资源包括地表水、地下水，还有大量客水汇集。地下水地域分布不均匀，大清河南及湖西区较为丰富，大清河北山丘区则缺乏。东平湖常年蓄水。随着大运河南水北调东线工程的开通，并利用东平湖蓄水，一级湖水位相对持续稳定。
地表水 据1956年至2012年东平县降雨量资料，年均为639.5毫米，降水总量为8.58亿立方米，人均占有1072立方米，年均径流深95.8毫米，地表水资源量1.29亿立方米，人均占有161立方米。
特点：地表径流年际变化大，1964年为丰水年，径流量2.9亿立方米，为年均1.29亿立方米的2.26倍。2002年大旱，径流量则为0。一年之内分配不均。汛期集中在7、8、9月，地表径流占全年的75%～85%；而3月—5月和10月—11月为农灌期，径流量比重仅占15%～25%。形成春旱，夏涝，晚秋又旱。地表径流量地域分布不均，北部山丘区地面坡度大，植被稀疏，降水入渗少。地表径流易造成水土流失并减少地表水资源利用。随着拦蓄提引工程的逐步完善，地表水的利用率占地表径流量的42.3%。客水主要来源于黄河、大清河上游、大汶河流域。年均入境客水总量为11.1亿立方米，年均引水利用2760万立方米。
地下水 境内地下水类型主要是松散堆积物孔隙水与裂隙岩溶水，年均综合补给量为2.06亿立方米。其中，可开采水量为1.85亿立方米。在分布上，大清河以南平原区为富强水区，地质成因由大清河冲洪积物堆积而成，为松散堆积物孔隙水，含水层为中组沙夹砾石，分布均匀，厚度大、埋藏浅、透水性好。大清河以北山丘区地质成因以寒武系、奥陶系为主，间有第四系冲洪积物。主要为裂隙岩溶水和第四系孔隙水。此水的赋存和富集，受地质构造控制，分布极不均匀，除跃进河、汇河西岸、肥、梁路西侧和白佛山前平原等地下水量较丰富以外，其余地带水资源贫乏。东平湖西部地下水主要为第四系孔隙水和寒武系基岩裂隙岩溶水，埋深一般为2～3米，补给模数在20万立方米/年平方公里。
地下水化学类型，在山丘区灰岩裸露或少有第四系盖层，岩石裂隙明显，岩溶发育良好，是地下水补给径流区，地下水运动短而流畅，地下水交替循环强烈。因此，形成了低矿化度的重碳酸钙型水。矿化度小于0.58g/L，阴离子表现为HCO3-、CO32-，而阳离子除Ca2+外，大部分含有Na+，其次为Mg2+。水质一般情况下甘甜。而湖西区，为氯酸钠、硫酸钠型水。阴离子以Cl-、SO42-为主，离子总量达2760mg/L，水质苦咸。
据地下水动向观测资料，大清河南地下水位保持稳定，略有下降，大清河以北山丘区水位有所回升，东平湖西区商老庄—银山地下水出现持续下降，2000年—2012年年平均下降0.38米。