清代漕运畅通时期，境内商业主要集中在运河沿岸的靳口、安山、戴庙及州城。靠舟楫之便，贸易兴盛。州城盐商在衙前设公店，在四乡集市设分店。除盐店外，其他较大的商业多数是杂货。大量的各种水产品在鱼市自由贸易。饮食业更为发达，有茶馆、馍馍坊、烧饼铺、煎炒馆、包子水饺馆等近200家，卖名吃、土产品的小商户遍及大街小巷。漕米由知州署向农民征收，年均5000多石，市场粮油购销繁荣，仅安山镇就有粮行几十家，整天大车小辆地运进运出。清光绪年间，东平还有集市35处，赶集上市的人少则五六千，多时上万人，甚至达到几万人，一派商贸昌荣的景象。
1902年，漕运告终，商业日趋萧条。民国时期，军阀混战，水旱连年，加之日军侵略，国民党军队占领县境，商业屡遭破坏。1948年，逐步恢复和发展。新中国成立后，本着自愿互利的原则，大力发展供销合作社。同时，按照“利用、限制、改造”的方针，扶持私营商业。1956年，通过对私营商业的社会主义改造，先后建立百货、贸易、食品、烟酒专卖、纺织品、药材、文化用品、煤建木材等8个国营公司和盐业经营组，按照计划批发零售。1958年，基层供销社下放到人民公社，实行农业社、供销社、信用社三社合一。在“左”的思想支配下，私营商业基本停业。1962年，通过贯彻“调整、巩固、充实、提高”的方针，国营商业控制了商品的批发市场和县城的零售市场。供销社系统的供应网点达330处。
“文化大革命”期间，国营、供销合作社受到干扰，私营商户停业。中共十一届三中全会后，社会主义商品市场进一步发展，逐步建立农工商结合、农商结合、工商结合、商商结合的商品流通形式。至1986年，全县有以百货公司、五金交电公司、副食品公司为骨干的三大批发公司，在州城、彭集、宿城、接山等乡镇供销社设立批发网点。1987年后，流通市场开放，各经营单位自主进货，自主定价、自主经营、自负盈亏。同时，鼓励职工停薪留职，到各基层供销社、综合楼、设立专门供货网点，享受批发价格，职工中间提成。1990年，县委、县政府鼓励个体工商户从事服务业、修理业、饮食业、小商品和农副产品批发零售业，境内购物中心、连锁超市、仓储式商场、物流配送等新型商业迅速发展。目前，东平的商业购物中心主要有四海商业城、儒原城市广场、华联超市、金汇商业街、斑鸠店大蒜批发市场、万德福二手车交易市场等。
四海商业城
四海商业城是综合性商业城。坐落在县城东南部，紧靠105国道。1990年动工兴建，1992年底交付使用，建筑面积39447平方米，总投资3900万元。入场经营业户400余家。有服装市场、布匹市场、日用小百货市场、农副产品市场、农用物资市场、汽拖配件市场及综合性批发市场，是全县最大的物资集散地。
儒原城市广场
始建于2004年，于当年6月26日正式开业，位于县城繁华的西山路中心地段，是一家大型的休闲购物商业性服务场所，总占地16亩，营业面积15000余平方米，员工600余人。以经营超市和百货业为主，注册资金550万元，固定资产5614万元，净资产2100万元，是东平县商业流通的龙头企业。先后被评为“泰安市百城万店无假货示范店”“山东省价格诚信单位”“山东省食品卫生诚信单位”“泰安市消费者满意单位”“优秀民营企业”等荣誉称号。
大蒜专业批发市场
位于斑鸠店镇驻地，占地面积215亩。主街长2000米，宽70米，全部为沥青路面。两侧建有商品交易房1600余间，建筑面积3.6万平方米，总投资6000万元。主要从事大蒜、大蒜制品、蒜苔批发，兼营各类蔬菜。市场内有饭店、宾馆、停车场，水、电、路、通信“四通”。大蒜及制品交易，覆盖梁山、东阿、平阴、东平等县30多个乡镇，经营服务人员1000余人，为鲁西南最大的大蒜产品集散地。2007年8月，“斑鸠店”牌大蒜商标荣获“山东省著名商标”称号。全镇建有大型恒温库48座，年贮量4万吨，恒温保存，择时出售。有大蒜加工企业18家，初步形成“产、加、销”一条龙，“科、工、贸”一体化产业化格局。产品销往全国各地，并出口日本、韩国、美国、加拿大、东南亚等十几个国家和地区。2015年，实现交易额10亿元，利税5000万元。
万德福二手车交易市场
位于县经济开发区井仓村南、105国道东侧。2012年9月成立，由山东万德福商贸有限公司主办。注册资金500万元，占地面积40亩。是集二手车交易、车辆展示、鉴定评估、车辆拍卖、新旧车上牌、汽车租赁、装饰、维修及后勤服务于一体的综合性专业市场。引进二手车鉴定评估机构东平县志远二手车鉴定评估有限公司和部分二手车交易经销企业（户）进场管理、经营。公司为其提供优质、高效、便捷服务，市场交易规模不断扩大，2012年，汽车交易量1400余辆，营业收入1.2亿元，贡献税收800余万元。
水浒度假酒店
位于东平湖畔、贯中大道西首路北，毗邻255省道和济菏高速公路，是集吃、住、行、游、购、娱为一体的综合性旅游休闲度假酒店。2009年4月，由东平水浒旅游开发有限责任公司投资2亿元，在原东平三中基础上改造建设，用地面积6.2816公顷，新建面积7000平方米，改造面积1.4万平方米。新建项目有大堂区、多功能会议室、餐厅、商务服务连廊区、摄影棚、休闲度假别墅区、空调控制室、人工湖、假山、园林绿化和道路铺设等；改造项目有客房楼、套房楼、娱乐中心、服务人员宿舍楼。建设标间和客房139间。其中，双人小大标间58个，双人小标间40个，单人标间21个，残疾人特房1个，套房19个，总统套房1个。多功能会议室3个，各式风格的餐厅16个，可同时容纳520人就餐。酒店消防安全监控设施先进可靠，为宾客提供安全舒适的工作和生活环境。至2015年，先后开展国际龙舟邀请赛、东南亚旅游团等多次大型接待服务活动。