20世纪80年代，全县继续开展以改水改厕、除“四害”（老鼠、蚊子、苍蝇、臭虫）为重点的爱国卫生运动。90年代中期，全县上下坚持开展“爱国卫生月”活动和创建“卫生县城”、“卫生乡镇”、“卫生先进单位”活动。1997年1月，宁阳县城被省爱卫会命名为“省级卫生城”。宁阳镇、磁窑镇、葛石镇、泗店镇、华丰镇、西疏乡、鹤山乡、茅庄乡先后被市爱卫会命名为“市级卫生乡镇”；华阳集团、磁窑国家粮食储备库、宁阳一中、宁阳四中被省爱卫会命名为“省级卫生先进单位”。至2002年，全县县、乡爱国卫生管理机构均建立健全。
一、除“害”防病
1985年，全县臭虫绝迹，蚊、蝇减少，鼠害严重。1986年起，全县健全完善县、乡（镇）、村三级灭鼠网络，逐级签订灭鼠承包责任书，制定相应的奖惩制度和具体措施，坚持每年春、冬开展2次突击灭鼠活动。1989年，被省、市命名为“灭鼠先进县”。1992年4月，成立宁阳县消杀服务管理站。2002，全县蚊、蝇消杀工作坚持以治本为主、以综合治理为主、以专业消杀队伍为主，对蚊、蝇消杀和蚊、蝇孳生地实行监控管理，蚊、蝇密度显著下降，减少了疾病的发生。
二、创建卫生城
1985～1991年，创建卫生县城工作以县城为中心，向四方延伸，整体推进，城区建设与创建卫生城同步进行，县城卫生状况得到明显改善。1992年，被命名为“市级卫生县城”。1995年，开展以整顿市容市貌、治理城区脏、乱、差为突破口的一系列综合治理和容貌达标活动。1996年，县政府成立创建省级卫生城指挥部，部署开展创建省级卫生城工作。先后拓宽改造了府前路、关桥路、西关路、文化路、交通路等6条主次干道；新建三里沟、松园、城隍庙居民小区；改建西关农贸市场，兴建1万平方米的富源巷商城；新建标准水冲式公厕4个，城区水冲式公厕达到9个；新建垃圾、粪便无害化处理场；在主次干道设立垃圾箱272个、果皮箱155个。同时，积极开展交通路容貌达标活动，新架设高标准路灯134盏；硬化小街小巷40条，铺装人行道1.1万平方米，装饰门头270多个，美化墙体4.5万平方米。是年，城区街道硬化完好率90%，人行道铺装率84.1%，路灯普及率和亮灯率98%以上，小街小巷硬化率80%，垃圾、粪便无害化处理率分别为42%和60%。本着“三季有花，四季常青”的原则，绿化美化了交通路、宁康路、关桥路，城区绿化覆盖率达到19.48%，人均占有绿地4.01平方米。1997年1月，被省爱卫会命名为“省级卫生城”。
三、城乡环境卫生
县城环境卫生 1985年，县城组建环境卫生清洁队。1990年12月，原城区环境卫生清洁队改建为县城环境卫生管理所，招收保洁人员对县城街道、公厕进行保洁管理。1991年4月，环境卫生管理所升格为二级事业单位，并更名为县城环境卫生管理处。是年，购买叉车、自卸车和洒水车等现代化作业工具。1992年7月，对县城9条路街实行承包，保洁面积25万平方米。是年，县政府拨款30万元，修建标准水冲式公厕4座。1994年，成立县城环境卫生监察队，严格查处乱运、乱倒垃圾和乱扔、乱抛废弃物等行为。1996年4月，在县城西北建60亩垃圾处理场一处。1997年4月，县政府发布《宁阳县县城市容管理规定》；11月，印发《宁阳县县城建筑垃圾管理办法》。2000年6月，公开拍卖县城10条主要街道、50万平方米的保洁权，实行招标承包，承包期一年，自招保洁员。2002年，环卫处拥有垃圾自卸车、洒水车、拖拉机、装载机、叉车、粪便抽排车等25辆（台）。县城区年生产垃圾4万多吨、粪便3000多吨，设垃圾箱120个，垃圾转运点53处，清运率99%以上。县城区保洁路街16条、面积79.8万平方米，有保洁员120人，人均保洁面积6650平方米。至是年底，共查处违反环境卫生管理条例（办法）行为1375件。
村镇环境卫生 1990年，全县20个乡镇驻地和部分村分别建立10～50人的环境卫生管理、清扫队伍。磁窑、华丰、堽城、东疏、伏山、泗店等镇建立环卫所，实行“四定二清”（定人员、定路段、定职责、定标准，一日两清扫，全天保清洁）管理办法。各乡镇配备3～10辆清运车，及时清运垃圾。2002年，全县12个乡镇共有环境卫生管理、清扫人员200多人，清扫面积23.84平方公里。乡镇企事业单位及各行政村还加强“两管”（管水、管粪便）、“五改”（改水井、改厕所、改畜圈、改炉灶、改环境）工作，农村环境卫生基本达到良好状态。
四、全民健康教育
1986年起，全县各级把全民健康教育贯穿于爱国卫生工作的全过程，全面贯彻实施“9亿农民健康教育行动计划”。全县建立健全县、乡、村三级健康教育网络，在县城主要街道设立健康教育宣传栏，向人们宣传有关卫生法律法规及健康知识。1988年起，县直各医疗卫生单位和乡镇卫生院开展候诊健康教育，业务科室设有兼职健康教育人员，门诊和病房设有健康教育专栏、健康教育处方等。广泛开展控烟教育，县城主要公共场所设立明显控烟标志。1993年，全县各中小学校普遍配备兼职教师，开设健康教育课，做到有课程、有课本、有教案、有成绩。1994年，县乡成立卫生宣传小分队，深入农村开展科学卫生知识宣传，进行服务咨询。1995年，县广播电台、电视台联合录制“健康行动”科教片，每周定期播放。各乡镇设立居民健康教育示范点，购置健康教育教材，发放到居民手中，定期开展健康教育。2002年，全县有各级专兼职健康教育人员967人，有60%的村庄办起健康教育夜校。是年，对宁阳一中、县实验小学进行健康知识和健康行为调查，学生知晓率和行为形成率分别达到95%和85%以上。全县中、小学生受教育人数累计98万人次。