1985年后，全县医疗卫生工作坚持“以农村为重点，预防为主，中西医并重，依靠科技与教育，动员全社会参与，为人民健康服务，为社会主义现代化建设服务”的方针，深化医疗卫生体制改革，全县防疫、医疗、乡村卫生、妇幼保健等工作蓬勃开展。1995年，宁阳县被省政府确定为“初级卫生达标县”；1996年，被卫生部确定为“爱婴县”。1997年，宁阳县城被省爱卫会命名为“省级卫生城”。2001年12月，全国基层卫生工作会议推广“宁阳卫生模式”，即组建医疗集团、加强农村三级卫生网建设、走农村卫生一体化之路的经验。是年，宁阳县被评为“全省农村中医工作先进县”、“全国防盲工作先进县”。2002年4月，县卫生局承担的药品监督管理职能移交新成立的宁阳县药品监督管理局；5月，全省第一家全国社区卫生服务示范基地落户宁阳。是年，宁阳县被省政府授予“全省农村卫生工作先进县”称号。年底，全县万人拥有医疗床位15张，千人拥有医生1.57人。