20世纪90年代中期，按照“产权清晰、权责明确、政企分开、管理科学”的现代企业制度要求，开始积极稳妥地推进多种形式的产权制度改革。
一、股份合作制改革
1994年，在全县企业中推行股份合作制。对规模较小、竞争力不强、盈利不多、亏损不大的中小型企业，全部或部分资产定向出售给内部职工，职工全员入股，建立起劳动者和资产所有者、按劳分配和按股分红的股份合作制关系，使企业成为职工共同出资、共同劳动、共享利益、共担风险的共同体。是年，县纺织厂、县电池厂、县印刷厂、县机床厂、县微型空压机厂、县五金厂、县草制品厂及县化轻公司、县生资公司等企业先后实行股份合作制改革。
二、企业多形式改革
租赁 1993年1月，县工贸艺品公司租赁县制鞋厂的厂房、设备，生产出口鞋。1998年，县华明热电有限公司租赁县自行车配件厂的厂房和设备，组建宁阳县华明钢球实业公司和宁阳县特殊工种培训中心。山东飞达化工有限公司租赁县艺品总厂的厂房、设备，并安置在册职工。县华兴机械厂、县服装厂、县植物油厂、县工贸艺品公司将企业的厂房、设备、经营设施分块租赁给内部职工和社会自然人经营，使大多数职工有活干、有收入，促进了社会稳定。
破产 1994年后，对扭亏无望、资不抵债、不能偿还到期债务的宁阳县塑料厂、宁阳县宁江联合机械厂、宁阳县肉联厂、宁阳县机床厂、宁阳县陶瓷厂、宁阳县自行车配件厂、宁阳县微型空压机厂等县属7家全民、集体所有制企业依法实施破产。
兼并 1995年起，经济效益好的优势企业开始对扭亏无望和破产重组企业的全部或部分资产实施兼并，并接受企业的全部在册职工。是年1月，宁阳农药厂兼并破产的宁江联合机械厂，成立山东宁阳农药厂化机分厂；3月，县石屯煤矿兼并破产的塑料厂，重组成立宁阳鑫泰塑料厂。1996年4月，宁阳农药厂兼并磁窑印刷厂，成立宁阳农药厂太阳印刷厂。1997年1月，泰安华宁矿业集团兼并破产重组的保安机床厂。是年，宁阳县酒厂兼并磁窑木器厂；山东海化集团跨地区兼并宁阳化工厂，组建山东海化魁星化工有限公司。
拍卖出售 1997年，开始把有净资产、生产经营活动正常的企业公开向社会出售，使国有、集体资产从一般性竞争行业中退出，收回资金专项用于相关企业改制和职工安置。是年11月，孔庆河一次性买断泰安市泰山电池厂的产权。2001年7月，泰安圣殿工贸公司购买宁阳县保安机床厂，一次性支付职工工资、集资、风险金，并收回国有资产收益92万元。鑫泰塑料厂职工王建军购买宁阳正大煤业公司鑫泰塑料厂压延车间。县微型空压机厂破产终结后，山东宁联机械制造有限公司出资200多万元购买地上资产，淄博山东达远集团出资600万元购买土地使用权，政府用处置资产及出让土地收益的800万元支付职工工资并妥善安置职工。
三、公司制改革
有限责任公司 1997年，在对企业资产进行审计评估的基础上，通过存量资产转让、债权转股权、吸收外部资本等手段，开始把单一国有、集体性质的企业改造为多元持股的有限责任公司。政府作为出资人依法行使选择企业经营者、资产收益、重大决策等权利，不再参与企业的正常生产经营活动。至年底，先后将宁阳县化肥厂、宁阳县发电厂、宁阳县酒厂等13户县属企业改造为有限责任公司。
股份有限公司 1998年，对经济效益好、投资需求大、具有良好发展潜力和经营前景的优势企业，按照《中华人民共和国公司法》的要求，组建规范的股份有限公司。山东海化集团兼并宁阳化工厂后组建的山东海化魁星化工有限公司，是山东海化股份有限公司的子公司。1999年初，以山东华阳农药化工集团有限公司为主发起人，联合省内外知名科研院所和相关企业共同出资，成立山东华阳科技股份有限公司。2000年1月19日，省政府向中国证监会推荐山东华阳科技股份有限公司作为高新技术企业，发行A股股票，2002年10月10日经中国证监会批准，同月31日在上海证券交易所成功上市。
四、“双置换”改革
2000年初，推行以民间资本置换国有（集体）资本和以社会自然人身份置换全民（集体）企业职工身份为主要内容的产权制度改革（简称“双置换”改革）。4月13日，县政府制定《关于进一步深化企业产权制度改革中转换职工身份经济补偿费用剥离项目及标准的规定》等一系列政策规定。8月，先后完成国有资本全部退出类型试点—山东飞达化工有限公司、国有资本参股类型试点—泰安华兴纺织有限公司和国有资本相对控股类型试点—宁阳县正大煤业有限公司等3户企业的“双置换”改革。是年9月12日，泰安市委、市政府在宁阳召开全市国有企业产权制度改革现场会，向全市推广宁阳县“双置换”改革经验。至2002年底，县属工业企业有8家完成“双置换”改革。