1985年，宁阳农场为国有农场，下设农业队、机务队、奶牛场、奶粉厂4个生产单位和蔬菜良种展销部1个经营单位。管理以承包责任制为主，即农田分种到户、奶牛分头到户、机动车承包到户，建立起职工家庭农场。实行生产、生活两费自理，包死基数，确保上缴，超收多留，歉收自补经济责任制，场、队、职工家庭农场三级管理，三级核算。是年，农场集体利益损失严重，职工收入差别较大，大多数职工在场部挂账。年底收回家庭农场，恢复统一计划管理体制。
1986年，场部对下属农业队、机务队、奶牛场、奶粉厂、蔬菜良种站实行场、队、组三级管理，场、队两级核算，超减计划产量和计划成本全罚全奖制度。这一管理体制，使生产开支年年超额，全场盈亏悬殊加大，出现了盈利的拿不到、亏损的赔不起、奖罚政策不能兑现的被动局面。1994年，宁阳农场成立宁阳县农垦实业公司。1998年初，对场属企业进行改革，奶牛一次性拍卖给个人，奶牛场、奶粉厂厂房设备租赁给奶牛购买者使用，建立起国有农场内部的第一家私营企业。对机务队实行个人风险抵押金承包；撤销蔬菜良种站、农垦实业公司和农业队，实行分田到户，重新建立职工家庭农场，恢复生产、生活两费自理，包死基数，确保上缴，超收多留，歉收自补的经济责任制。职工自理福利费、职教费和工会费。农场与职工签订土地承包合同，明确双方权利和义务。职工向企业缴纳土地承包费，以实物计征，亩折合小麦280公斤。
2000年9月，推行“两田制”，将全部耕地分为经济田和大田，职工自愿申请承包，自理生产费、生活费和社会保险费。经济田人均2.5亩，实行自主生产、自主经营、自担风险、自负盈亏，免除上缴的土地承包费（含农业税）。大田人均承包28亩，首季统一小麦品种布局，秋季自由种植。实行包死基数，确保上缴，超收多留，歉收自补，每亩每年上缴土地承包费（含农业税）以实物计征为小麦良种280公斤。
2001年4月，进行股份制改革。是年11月22日，在县工商局办理注册登记手续，成立宁阳县垦丰种子有限公司。公司注册资本金100万元，其中，国有股89万元，原农场职工245人入股，募集股金11万元。