区、乡、村三级疾病控制网络建设得到加强。2004年，兴建区疾控中心。作为全省首批“两个体系”（公共卫生疾病预防控制体系和医疗救治体系）建设的重点建设项目之一，该项目共占地1.5公顷，总建筑面积7700平方米，总投资2000多万元。2006年5月竣工并投入使用。2006年5月，撤消区卫生防疫站，成立区疾病预防控制中心和区卫生监督局。以区疾控中心的成立和迁址为动力，狠抓了处镇防保站（卫生院）、村街卫生所的机构建设、改貌建设、分村卫生机构一体化管理等工作。全区形成以区疾控中心为龙头，以区直医院及处镇卫生医院为骨干，以村街卫生所为网底的三级疾病预防控制网络。疫情及突发公共卫生事件报告网络日臻完善。2007年，建立起以区疾控中心为平台，上接省、市疾病预防控制机构，下连辖区各级各类医疗卫生机构和49个防疫检测点的疫情值班和突发公共卫生事件信息报告系统。实行疫情直报和24小时疫情值班制度。
加强突发公共卫生事件应急演练。做好突发公共卫生事件应急物资、技术、人员储备，组织开展突发公共卫生事件应急演练，内容涉及霍乱疫情、流行性感冒、人禽流感、手足口病疫情暴发等事件，应急反应能力明显提高。