2003年4月，符合正常晋档条件的450名机关事业单位工作人员提高工资档次，月增资1.2万元。7月，全区6269名机关事业单位在职人员调整工资标准，按人均月增资50元，全区月增资31.3万元。同年，为2001～2002年度机关事业单位工人技术等级考核合格人员共147人办理办理相关工资手续。全区机关事业单位住房补贴发放比例由基本工资额的10%提高为25%。为2002年度考核称职（合格）及以上的机关事业单位工作人员发放年终一次性奖金，标准为12月份基本工资。
2004年3月，全区5549名机关事业单位符合正常晋档条件的在职人员提高工资档次，月增资19.4万元，全区符合级别晋升条件的约180人晋升一级级别工资，月增资0.8万元。4月，全区机关事业工作人员发放目标管理奖，每人每月60元。4月，全区机关事业单位住房补贴发放比例由基本工资额的25%提高为35%。
2005年4月，全区机关事业工作人员发放考勤目标奖，每人每月60元。5月，全区符合正常晋档条件的720名机关事业单位工作人员提高工资档次，月增资1.6万元，符合级别晋升条件的96名机关事业单位工作人员晋升一级级别工资，月增资0.48万元。10月，全区机关事业单位工作人员按职务级别发放岗位津贴，人均增资350元。
2006年4月，全区符合正常晋档条件的5300名机关事业单位工作人员提高工资档次，符合级别晋升条件的130名机关事业单位工作人员晋升一级级别工资。
2007年6～7月，全区机关事业单位中，除部分参照公务员管理的事业单位外，基本完成了工资改革。工资改革对公务员、事业单位工作人员工资制度和收入分配秩序进行规范，完善正常增资办法。增资情况如下：1.机关单位，公务员677人，月增资216125元；机关工勤人员70人，月增资13181元。2.事业单位，专业技术人员3974人，月增资1220676元；管理人员504人，月增资132855元；工人384人，月增资83691元。同时，为离退休人员办理了离退休费，全区机关事业单位离退休人员2423人，月增资682295元。8月，全区5125名考核合格及以上的事业人员晋升薪级工资，月增资10.2万元。