1985年7月19日，成立泰山区水利水产站，编制5人，隶属泰山区农村工作办公室。1988年12月23日，成立泰山区水利水产局，为一级行政单位，编制15人，其中行政编制5人，事业编制10人。设秘书科、防汛办公室、水资源管理办公室、水土保持办公室。
1993年机构改革，水利水产局内设办公室、财务办公室、水资源管理办公室、水利站、水产站，编制18人。1995年，全区水利水产系统工作人员26人（含处乡8人）。是年，泰山区水利水产局被山东省水利厅授予全省水政工作先进单位；被山东省人事厅、水利厅授予山东省水资源管理先进集体。1996年，全区7个处（乡）均设水利水产站，编制9人。
1997年8月15日，区政府印发《泰山区水利水产局职能配置、内设机构和人员编制方案》，水利水产局设办公室、计划财务科、水政科、科技教育科、水资源科、水土保持科6个科室，编制18人，其中行政编制4人。同时撤销7个处乡水利水产站。9月30日，建立泰山区水保、河道维护费征收办公室，为股级自收自支事业单位，编制8人，隶属区水利水产局。
2000年6月，增设河道工程管理科。年底，水利水产局内设办公室、计划财务科、水资源科、水政科、水地保持科、河道工程管理科、科技教育科、防汛抗旱指挥部办公室及水保、河道维护费征收办公室9个科室，辖9个科室，辖抗旱服务队、打井队、农水站、工管站、水政监察大队、水产站、淡水养殖试验场及泰山赤鳞鱼繁育养殖中心8个单位。水利系统工作人员36人（含处乡10人）。省庄、邱家店两镇保留水利水产站，有工作人员5人。