1985年，区政府印发《关于建立内部审计机构加强审计监督的通知》。是年，商业、粮食、工业、物资、供销社5个部门建立内部审计机构，配备专兼职工作人员。翌年2月，制订《内部审计监督工作暂行条例》。6个区直部门和5家企业建立内部审计机构，专兼职审计人员12名。工业公司组织内审人员对5家企业进行审计，查出有问题资金22.5万元，1987年，开展内部审计35项，查出有问题资金70万元，其中：违纪金额30万元提出审计建议130条。1988年，举办内部审计学习班3期，培训人员110名，开展以审代培116人次。是年，共审计单位70个，查出违纪金额35万元、损失浪费金额11万元，为承包经营企业提出改进意见116条。1989年，内部审计机构增至19个，专兼职审计人员160人，其中专职审计人员59人。举办内部审计学习班2期，培训人员130名，首次举办内部审计工作理论研讨会。是年，共审计项目157个，纠正违纪金额75万元，查出损失浪费金额8万元，纠正帐务差错37笔。1991年，全区7个处乡均建立审计办公室，配备专职人员14名，并举办处乡审计人员培训班1期。是年，审计项目115个，查出损失浪费资金8万元，纠正违纪违规金额49万元，核减工程决算金额7万元。审减贷款金额20万元，审增税额6万元。纠正违纪事项124笔34万元，纠正帐务差错133笔61万元。
1992年，审计项目135个，纠正违纪违规金额27万元。1993年，举办新会计制度培训班3期，培训人员109人。是年，审计项目115个，纠正违纪金额23万元，查出损失浪费金额6万元。1995年，审计项目137个，纠正违纪金额91万元，查出损失浪费金额71万元。至1998年对企业定期审计、承包离任审计、基建审计中共审计项目853个，纠正违纪金额552万元，减少浪费金额393万元。1999年，审计项目248个，纠正违规金额160万元，查出损失浪费金额120万元。2000年审计项目259个，纠正违规金额178万元，查出损失浪费金额120万元。