境内铁山、岗山、葛山、尖山、峄山等摩崖佛教刻经，均在公元6世纪50年代形成，这充分证明在南北朝时期，佛教在邹县已相当盛行。进入唐代，因统治者崇尚佛教使佛教大盛。峄山素为宗教云集之地，佛、道教曾在峄山发生过2次重大冲突；武周女皇武则天时期，5000余僧徒攻打峄山，峄山仙人棚、万寿宫道长率千余道人迎战，由于僧徒地理不熟而失败。金、元易代时期，大明府僧人智究来峄山占据山阴17座庙宇。因其拥金反元，道众趁元军进军邹县之际，利用元军驱逐了僧徒。明洪武年间，佛道两教已经和解，并相互渗透，鲁王朱檀信奉道教，但也出资兴建了僧徒居住的峄山孤桐寺。万历年间（1573—1620年），筹建供安道大藏经的道藏阁时，就由佛道2家共同筹办。清乾隆五年（1740年）重修天竺观时，观主为龙门派闻一桂，塑像既有观音、文殊、普贤佛像，也有“眼光送生居其右，疹痘子孙居其左”。弥陀庵主持僧人先后有智恕、惠学、来智、桂如、自弘等。
佛教除在峄山活动外，境内较大的寺庙还有：安上村泰山行宫，始建于唐朝，有房屋殿堂44间，土地40亩，尼姑4人；莫亭村天齐庙有房屋6间，土地31亩，尼姑3人；渐兴村十方院，始建于明代，有房屋殿堂32间，土地62亩，有僧1人。此外还有香城的奶奶庙，南宫村的关帝庙、寺上村的白泉寺等。至建国前，全县有佛教寺院36处，僧尼70余人。建国初，还剩有寺庙6处，房屋殿堂113间。土地275亩，僧5人，尼9人。1961年尚有僧4人，尼5人，1964年佛教活动停止。1988年，有尼姑2人，其中1名还俗嫁人。寺庙已全部废圯。