道教为汉朝创立，尊老子为教主。东汉末年传入邹县，主要集中在峄山。时，有方士郗俭在峄山南华观东华阳楼阁修炼。创建太平道的黄巾起义军也曾驻过峄山。峄山上的大龙口、漏灵台、点将台、万忠沟等都与黄巾军有关。起义军失败后，有的隐居于峄山修道。北魏太武帝拓拔焘崇道排佛，在峄山大兴土木，修建起天师堂。宋末金初，峄山道教兴盛，系全真道北宗，一直延续到清代，先后分为6个派别。
随山派 创始人金代道士刘处玄（1147—1203年），为全真道北宗七真之一，东莱（今山东掖县）人。金大定十二年（1172年），首次来峄山，先后住白云洞、隐仙洞、万人洞，并收王贵实为徒，命守峄山炉丹峪。次年4月二次来峄山，定峄山为随山派隐修之地。并命其弟子姚志翊（道号安然子）由东海来峄山，奉守白云宫。后以次相继者，炉丹峪方面，有史志道、李志椿；白云宫之下有王志顺、马道明。其中尤以史志道修炼突出：其值金元易代之时，深隐不出，苦行自力，擅“仙掌”、“铁脚”武功。年临耄耋，仍朱颜皓发，神采奕奕，无昏惰之容。至元二十九年（1292年）壬辰十二月十三日无疾而化，终年86岁，元朝寿王追赠“淳然体道明德真人”。随山派在峄山前后传8代，历120余年。明代，其道观转归华山派主持。
清净派 创立人孙不二（1119—1182年），为全真道北宗“七真”中唯一的女性，世称“孙仙姑”，号“清净散人”，宁海（今山东牟平）人，马丹阳之妻。其弟子李崇彦于金大定年间，在峄山建玉泉观，先后传李淳锡、张道真及刘道元，共3代，历时近80年。
华山派 创立人郝璘（1140—1212年），法名大通，称太古真人，号广宁子，宁海人。明洪武年间，有华山派道徒“南无寂真人”主持峄山香火。明永乐初年，因有峄山华山派道士参与惠帝复位嫌疑，明成祖加兵峄山，道教一度沉寂。明宣德四年（1429年），有华山派道士李教秀由华山东游峄山，重开峄山各道观。至嘉靖年间，道众达1300多人，宫观573楹，拥有土地3700亩，明万历三十一年（1603年），明神宗“印造道大藏经，颁施在京及天下名山宫观。”并赐银60两。峄山佛、道两家共建道藏阁一座，存放《续道藏》一书，购置落陵社民田两顷余。明末清初，有另一华山派道士郭上德来峄山修炼。著有《修隐》12卷、《山野生息》4卷。华山派在峄山上先后传11代，历时300余年。
龙门派 创立人丘处机（1148—1227年），字通密号长春子，栖霞人。清朝为龙门派在峄山盛行时期，该派300余年，世传16代。民国年间，17代传人王教山（今看庄镇兴隆寺村人），四处奔波募化，足迹遍6省数百县，募款银洋万元，当时任国务总理的邹县人靳云鹏捐献银洋2500元。利用此款项修缮峄山盘路9条7500余级，山门8道，善门12道，庙宇72所，亭台楼阁17处，立碑24块，整理孔洞幽穴和掩谷平路近100处。当时县令曾催逼王教山出资兴办学堂、王不服，遂兴讼事。官司打到北京军阀政府，在北京全真道白云观主高云溪的帮助下，又通关节于靳云鹏，终以道家胜诉，成为轰动一时的“峄山教案”。王教山还撰写《峄山仙真记》和峄山志稿共10万余字。
真大道教（原名大道教） 创立人刘德仁（1122—1180年），号无忧子，沧州乐陵人。在峄山从第5代传至9代，常住一、二人，前后不过十几人，一直未能兴盛，后自行消失。
仙天道 起源于清咸丰年间，是道教正一派的一个分支。民国后期消失。
境内道教活动场所主要集中在峄山，其它地方也有分散活动场所。在西关山西会馆的关帝庙，乾隆年间曾有一姓柴的道士主持，共传9代，至邹县第一次解放（1945年）尚存殿堂房屋80余间，土地72亩。岗山玉皇庙传说始创于唐代，有房殿15间，土地120亩，香火旺盛时，年收入两、三千吊制钱。昌平山玉皇庙在建国前有居士和道士50余名、房、殿26间，土地85亩。
至建国前夕，全县有道教活动庙宇170处，房屋殿堂693间，土地1835.5亩，道士约200人。建国后，1956年，有庙宇46处，道士68人。1961年，道士均回家参加集体劳动。1986年，峄山开辟为旅游区后，有4名道士又回峄山从事宗教活动。