元代，回民从甘肃、陕西等地陆续迁至境内，多定居西关，伊斯兰教随之传入，传播也仅局限于回民中间。曾在西关建清真寺，有房屋3间。1685年(清康熙二十四年)2月在西桥南新建清真寺1处。后，清真寺增至5处，分别在西御桥南、东葛店、竹亭、玄帝庙、黄家庙。清末民初，西御桥南清真寺进行修葺，有大殿1座，讲经堂5间，水屋2间，计房屋30间。前有大门，两边各有侧门，院内有二门、亭子和井亭等。清真寺为伊斯兰教传播宗教知识、进行宗教活动的中心，常年聘有阿訇，主持宗教活动和处理民俗事务。
伊斯兰教的主要节日有圣纪节、开斋节、古尔邦节(又称宰牲节)。平时，驻地教民每星期五“主麻日”正午先到清真寺沐浴，后着礼服进大殿，集体面向西方诵经，谓之做礼拜。每逢节日，教民均沐浴盛装，到清真寺聚会，相互问候、祝福。圣纪节集体作礼拜，听阿訇念经、讲经、赞经，捐献“功德”。开斋节在清真寺举行会礼仪式后，一般家庭多备置各种饭菜宴请宾客。过古尔邦节时，家家把房舍打扫干净，装饰一新，并宰牛羊，制糕点，到清真寺沐浴，举行节日会礼，参加宰牲仪式。
1938年4月，中国回教协会滋阳分会成立，有会员664人。1947年7月，滋阳分会召开代表大会，通过协会章程，选举理事长1人，常务理事4人。
建国后，去清真寺作礼拜的教民有所减少。“文化大革命”期间，城内清真寺被拆除，1990年4月，重建大殿1座，讲经堂、水屋和其他房屋共19间，面积560平方米。1995年3月，修复东葛店村清真寺，有大殿10间，南北讲经堂6间，面积300平方米。全市有活动场所5处，教民4000余人。聘有阿訇4人，主持宗教活动。
表28-1 兖州市清真寺一览表
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│寺名 │始建年 │原规模 │沿革与现状 │现任阿訇│活动人数│
│ │代地点 │ │ │ │ │
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│城内 │1685年 │占地2.5亩，房屋 │“文化大革命”中拆除，重建于1990年4月 │马洪恩 │800余人 │
│西御桥南│2月建 │30间，450平方米 │，建成大殿、讲堂、水屋等19间，560平方 │ │ │
│清真寺 │西御桥南│ │米 │ │ │
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(续表)
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│寺名 │始建年 │原规模 │沿革与现状 │现任阿訇│活动人数│
│ │代地点 │ │ │ │ │
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│谷村镇│1717年建│占地10亩，房屋 │大队、学校占用，“文化大革命”中拆除│石君佑 │1000余人│
│东葛店│东葛店村│33间，533平方米 │大部。1995年3月，修复殿堂16间 │ │ │
│清真寺│ │ │ │ │ │
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│谷村镇│1717年建│占地5亩，房屋1 │大队占用，“文化大革命”中部分拆除，│马洪恩 │150余人 │
│黄家庙│黄家庙村│3间，270平方米 │现有大殿3间 │ │ │
│清真寺│ │ │ │ │ │
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│王因镇│1835年建│占地5亩，房屋8 │大队占用，“文化大革命”中部分拆除，│袁启光 │250余人 │
│前竹亭│前竹亭村│间，218平方米 │现有3间 │ │ │
│清真寺│ │ │ │ │ │
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│前海乡│1835年建│占地5亩，房屋8 │“文化大革命”中部分拆除，现有3间 │许昌增 │600余人 │
│玄帝庙│玄帝庙村│间，218平方米 │ │ │ │
│清真寺│ │ │ │ │ │
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