抗日战争时期，伪防疫委员会兖州诊疗所曾在城内公共厕所、污水坑、池塘喷药消毒。每年还令城镇居民进行2～3次卫生扫除。
1948年8月18～25日，兖州市人民政府组织城镇军民对城镇卫生进行彻底清除，开展卫生防疫突击运动周活动，市容市貌焕然一新。
50年代初，城镇组织清扫队，后改为“金汁业”合作社定期清扫街道，清运垃圾，统一清理厕所粪便。1958年统一规划，整修街道，疏通府河。结合兖(州)济(宁)铁路复修，整修货站及车站下街道。填平东护城河，改造街道环境。
1964年，县爱卫会对城镇垃圾、粪便实行统一管理，公共厕所放置灭蝇药物、工具，街道定点设置公用垃圾箱。1965年城镇清洁卫生委员会成立，有清洁工人30人，负责城镇清洁卫生。
1977年兖州县城镇清洁卫生管理委员会(简称清管会)成立。县革命委员会颁发《城镇清洁卫生管理通告》。全城划分40个卫生区，垃圾、粪便由清管会统一清运、管理。
1978年4月，县爱卫会发动城镇数万人，突击清理街道30多公里，清运垃圾3000立方，新设垃圾箱(池)160个。年底，县爱卫会制定《兖州县城镇工厂、机关、学校、居民、企事业单位卫生要求》、《城镇卫生管理条例(试行)》。城区划分单位卫生包洁区，规定每天清扫，每季组织一次检查。
1982年，县委、县政府将爱国卫生运动纳入精神文明建设规划，规定每年3月为文明礼貌月。在元旦、春节、“五一”、“七一”、“十一”等节日期间开展卫生突击和卫生检查评比活动。县爱卫会制定城镇单位卫生标准，实行门前“三包”(包绿化、包卫生、包秩序)、门内达标(达到卫生标准)。1990年拆除旧垃圾箱(池)，建吊笼式垃圾中转站和台式垃圾箱等卫生设施，有560个城镇单位达到山东省爱卫会规定的行业卫生标准。
1993年6月，市委、市政府做出《关于创建省级卫生城的决定》，制定创建方案，成立领导小组，市长任组长，发动全市群众治理环境卫生，增建卫生基本设施。是年底，省爱卫会对兖州城镇检查验收后，命名为省级卫生城市。1995年城镇有吊笼式垃圾中转站5处、台式垃圾箱20个，水冲式公厕16处，果皮箱136个，垃圾、粪便处理场各1个等卫生基本设施，为城镇卫生的进一步开展奠定了物质基础。