1956年1月，县人民委员会号召全县人民人人动手、家家扫除，干干净净过春节，城乡普遍开展烟薰火燎灭蚊蝇，毒饵灭鼠活动。9月6日，县人委召开爱国卫生模范表彰大会。
1958年12月，县召开消灭老鼠、苍蝇、蚊子、麻雀(后除麻雀改为除臭虫)除“四害”、讲卫生万人誓师大会。1959年12月成立县围歼麻雀战役指挥部，全县消灭麻雀21万余只，掏雀窝3.9万余处，灭鼠3.2万余只，堵鼠洞2.2万余处。城乡广泛开展“六挖”(挖厕所、猪圈、牲畜栏、鸡窝、积肥坑、污水坑)、“五改”(改造厕所、粪场、猪圈、积肥坑、污水坑)、“三清理”(清理人、畜粪便、杂草)、两倒(倒盆、倒罐)、“一堵”(堵树洞)、“一通”(疏通沟渠)活动，消灭蚊蝇孳生地。
1964年春，发动3万多名中小学生挖蝇蛹。县乡卫生单位对蚊蝇孳生地喷洒药物，居民用“六六六”烟薰剂消灭室内越冬蚊蝇。城镇1104处厕所备有“六六六”药粉袋、蝇拍等。“文化大革命”期间，除“四害”、讲卫生工作受到严重干扰。
1979年，开展灭鼠防病保粮活动。公社、生产大队建立灭鼠领导小组，每10户配备1名灭鼠员。1983年全县灭鼠实行“五统一”(统一时间、统一筹集资金、统一掺拌毒饵、统一投药、统一技术指导)、“五不漏”(投药不漏村、不漏户、不漏房、不漏次、不漏处)。
1986年起，灭鼠活动实行经济责任制，县与乡(镇)、乡(镇)与各村签订灭鼠合同。全县每年统一灭鼠3次。是年经济宁市卫生局考核，全县家鼠密度平均为0.5%，野鼠密度为1%。1987年济宁市地方病领导小组授予兖州县“灭鼠一役达标”称号。县成立蚊蝇消杀服务站，在城镇开展统一消灭蚊蝇工作。1989年，县达到省规定的基本无鼠害标准，荣获证书。1990～1995年，市爱卫会每年于夏、秋季节组织群众开展消灭蚊蝇活动，清除蚊蝇孳生地。市组织有关单位对城乡灭鼠活动组织检查，巩固灭鼠成果。