1966年在土山下构建人民防空指挥所，建有指挥室、工作间、掩体、上山通道和警报装置。1969年珍宝岛事件后，掀起了群众性的人防备战挖洞热潮。所挖工事多为简易人行通道和掩体，工程类型为掘开式和地道式工事。1971年全国第二次人防工作会议以后，全县开始了大规模的人防工程建设。1972年，县人防工程建设计划列入全省基本建设计划，1974年9月，兖州被定为人防重点设防城镇。1975年，县运输公司用了9个月的时间，建成了一个总面积692平方米，三巷回廊的地道式工程，该工程为砖体结构，双层被覆，防水性能良好。1976年，县人防办在山东省人防工程建设经验交流会上，作了经验介绍。到1979年，已建有一批设施比较齐全，符合人防战术技术、达到防核、防化、防生物武器要求的人防工程。工事数量达到国家规定人均占有标准，基本具备战时留城人员疏散、隐蔽的条件。1987年对全县人防工程进行了普查、建档。在城市建设中，按照平战结合要求，建设了一批地下仓库、地下病房、地下商店。1989年，投资200万元，建平战两用工程1处，建筑面积1000余平方米。至1995年底，全市人防工程建设初具规模，共建人防工程28766平方米，其中，等级工程(符合人防工程战术技术五级要求)16处，工程使用面积7065平方米；简易工程110处，可利用面积21701平方米；城区内疏散干道及连接通道9800平方米，长5810米；战时指挥所1处，医疗救护所1处，平战两用地下商场1处。
人防工程除用于战时防空袭以外，根据平战结合原则，因地制宜，开发利用了部分工程设施。至1995年底，全市已开发利用14383平方米，工程利用率占工程的50%。