兖州市地处泰沂山区前倾斜平原，土质较好。原生植被早为次生植被所代替。境域属半潮湿温暖气候带，植物资源较丰富，除少数藻类、苔藓、蕨类植物外仅被子植物就有600余种，分属50余科，其中以禾本科、豆科、蔷薇科、十字花科植物较为普遍。
境内植被以道路林网为连线，农田作物为主，自然草被作镶嵌，形成了有乔木、灌木、草本植物和低等植物相结合的植物群落。
乔木以杨、柳、刺槐、泡桐等速生落叶、阔叶树种为主。
灌木有桑、紫穗槐、牡丹、月季、酸枣、大小叶黄杨等。
草本植物包括农作物和自然草被。农作物以小麦、玉米、棉花、花生、大豆、西瓜、黄瓜、蕃茄、白菜、萝卜等为主；自然草被多为1年或多年生植物，以茅草、小蓟、荠、马齿苋、藜、苋菜、蒺藜、草熟禾、三棱草、打碗花、蒲公英、地丁、问荆、马兰、车前草、益母草等为主。苔藓植物和蕨类植物多在雨季出现。低等植物主要有绿藻、蘑菇、木耳等。
境内植被占总面积的82%。其中农田占植被面积的80%；林地占19%；自然植被占1%。农作物种植密度大，郁闭度高。林地覆盖率达16%。