清末，县设户房，管理田赋丁银。1913年(民国2年)设财政科，掌管田赋等。1938年后，伪县政府设田粮处。1946年初，国民党滋阳县政府设田粮科，隶属山东省田赋粮食管理处。
1945年3月，县抗日民主政府设财粮科，负责田赋、公粮、柴草等征收事宜。
1948年7月，兖州市设财粮科，滋阳县设粮食局，徐州第三粮食分局兖州办事处下设兖州、滕县、邹县3个粮站。12月市财粮科并入滋阳县粮食局，下设城关、大安、新驿、嵫山、泗庄、长庆6个区粮库。1949年6月，徐州粮食分公司兖州粮食部建立，1950年3月改为兖州支公司，负责境内粮食购销业务。5月，撤销6个区粮库，成立中央粮库，下设城关、嵫山、顿村中央支库。1952年11月，将兖州粮食支公司、兖州粮站并入滋阳县粮食局，设秘书、会计、计划、储运、业务5个股。1954年3月成立滋阳县油脂经营组。是年撤销中央粮库，归属县粮食局，设城关、谷村、大安、小孟、新驿、颜店、泗庄、王因、道沟9个区粮食管理所和嵫山粮库。1955年10月，将油脂经营组改为中国油脂公司。1957年7月，油脂公司并入县粮食局，8月增设加工股。
1958年11月，滋阳县粮食局改称曲阜县粮食局。1962年1月，改为兖州县粮食局，辖城关、大安、新驿、泗庄、王因、道沟6个公社粮食管理所和嵫山粮库、兖州县面粉厂、榨油厂。6月增设谷村、小孟、颜店、黄屯4个公社粮食管理所。1966年5月，增设城镇机关粮油供应站。
1968年成立县粮食局革命委员会，1971年12月，改为县粮食局。下设秘书、人保、财会、计划、购销、储运7个股。1972年增设红星、漕河两个粮管所。
1980年11月，增设粮油议价购销公司和旧关粮库。1982年1月，增设娄庄、店子两个粮管所，1984年5月撤销。是年增设饲料公司和粮油复制品厂。1986年11月兖州镇粮所与机关粮站合并设立兖州县粮油供应公司，机关粮站改为机关粮油食品店，隶属县粮油供应公司。1987年10月，兖州县粮油复制品厂改为兖州县粮油食品厂。县粮食局增设审计股。
1991年9月，改革粮食经营管理体制，增设东郡粮食批发市场，12月，成立县粮油购销公司，隶属粮食局。1994年4月，机构改革，组建兖州市粮油集团总公司和粮食局同一机构两个牌子。1995年12月，撤销市粮油集团总公司。市粮食局设办公室、政工、财会、商贸、工贸、审计等8个科室。辖粮油供应公司、粮油购销公司、粮油贸易公司、饲料公司、东郡商场、市油脂食品总厂、市粮油食品厂、市面粉一厂、二厂、养殖加工厂及新兖、谷村、漕河、小孟、大安、新驿、颜店、前海、泗庄、黄屯、王因、兴隆庄12个乡镇粮食管理所。