兖州市境域，明、清至民国，同。《滋阳县志》载，“东界曲阜十里至县城三十里，西界济宁二十里至州城六十里，南界邹县二十里至县城五十里，北界宁阳三十里至县城五十里，西北界汶上六十里至县城九十里。东西广五十里，南北袤八十里”。总面积585平方公里。1938年日军入侵和国民党占据兖州时，境域未变。
1948年7月兖州解放，为适应新形势需要，所辖村庄与邹县、济宁、曲阜作了调整，境域变动较大：原属邹县的刘家楼、小施村、大施村、魏家井、水坑、大庙、田家庙、刘岗、和尚堂、澹台墓、雷家厂、南张村、王家楼、谢家集、程家行、大南湖、小南湖、樊庄(前、中、后樊庄)、 椤树、王庄、北湖、道沟、汪家庙、前小疃、后小疃、钱家村、张村、戏楼、申家街、店子、西兴隆庄、后侯家营、前侯家营、北许、东郭家营、史家营、韩家堂、丁家庄、田家庄、社仓、储家庄、南许、河口、业庄计46个村和原属济宁县的蒋屯、黄屯、褚屯、孙氏店、小辛庄、李屯、祖营、于家厂、茶庵、马庄、孙氏闸、三仙庙、高汪庄、赵庄、周家 堆、玄帝庙16个村划归滋阳县；原属滋阳县的粉店、南杨庄、魏家庄、张家庄、小果庄、大果庄、牛厂、依仁村、西郭家村、东郭家村、章枣、古路沟、赵家庄、小厂、苑庄、五福庄、肖家庄、官庄、辛村、徐家庙、杨家店、佃户屯22个村划归曲阜；北刘庄、皇桥2个村划归济宁。时，全县面积648.2平方公里。1958年11月，曲、滋合并，境域扩大。1962年1月按原行政区域分治，至1995年，兖州市境域未再变动。