1983年，南四湖资源调查协作组，在全湖设马口西南、独山南、仲浅西、南阳西、郗山湾、龟山北、韩庄五段之间、微山岛南和洙赵新河、东鱼河、万福河、十字河河口、微山造纸厂航道河口等25个(上级湖15个，余在下级湖)站点，分4次(1983年4月29日～5月2日；7月11日～14日，9月24日～26日；11月27日～29日)采取水样，观测化验水体的物理性状和化学因子。其结果是：
透明度：湖心明水区水色低，透明度高。其次是水草区。在有明显污水的入湖河口处，水色高，透明度低。透明度的变化范围为0.22～2.85(见湖底)，全年全湖平均值为0.92米。上级湖平均1.04米，下级湖平均0.77米。
含盐量(单位：毫克/升-MG/1)：秋季雨量充沛，湖水位高，含盐量最低，平均值为422；夏季高温少雨，水位下降，含盐量高，平均值为526，全年平均484。随着工业污水的排入，有逐渐增加的趋势。
pH值：据测定在7.1～9.7之间，基本符合淡水渔业用水pH值6.5～8.5的指标要求。pH值的季节变化大，全湖4次25个采样点的平均值为7.6～9.3。其中，上级湖平均7.9，下级湖平均7.6。但各点间差异很大，以吕蒙、山头之间的主航道最高，达9.7。南阳西的居民生活区最低，仅7.1。
溶解氧(单位：毫克/升-MG/1)：全湖平均8.71。其中，上级湖9.01，下级湖7.94。凡有工业污水入湖的河口，较全湖平均值低2～3。溶解氧季节变化较明显，盛夏7月含量最低，入冬前11月含量最高。
耗氧量(单位：毫克/升-MG/1)：全湖平均3.85，夏季最高，平均5.81；春季最低，平均2.5；秋冬平均值分别为4.7、2.7，季节变化较明显。
总碱度(单位：毫克当量/升-MG/1)：全湖总碱度2.36～4.23，平均3.06。其中，上级湖平均3.16，下级湖平均2.93。季节变化以秋季最低，平均2.73，枯水季节最高，年均3.39。
总硬度(德国度)：全湖平均值10.4度，有废水污染的河口硬度偏高，全年以秋季最低，春季最高。
碳酸根离子(CO3--)，(单位：毫克当量/升-ME/I)：全湖平均0.20，占阴离子总量的2.87%。其中上级湖平均0.15，下级湖平均0.27。春季含量较低，夏季含量较高。
碳酸氢根离子(HCO3--)，(单位：毫克当量/升-ME/I)：全湖平均2.86，占阴离子总量的41.11%。其中，上级湖平均3.92，下级湖平均2.66，季节变化不大。但在有工业废水入湖河口处，含量高于其他采样点。
硫酸根离子(SO4--)，(单位：毫克当量/升-ME/I)：全湖平均1.92，占阴离子总量的27.62%。其中，上级湖平均2.03，下级湖平均1.78，湖水污染处含量较高。全年以秋季最低，平均1.63；夏季最高，平均2.3。
氯离子(CI-)，(单位：毫克当量/升-ME/I)：全湖平均1.97，占阴离子总量的28.38%。其中，上级湖平均2.08，下级湖平均1.84。居民生活区高于其他水域，季节变化较明显。
钙离子(Ca++),(单位：毫克当量/升-ME/I)：全湖平均1.67，占阴离子总量的24.01%。其中，上级湖平均1.69，下级湖平均1.64。全年以夏秋两季含量较低，春季较高。
镁离子(MG+±)，(单位：毫克当量/升-ME/I)：全湖平均2.04，占阳离子总量的29.22%。其中，上级湖平均2.17，下级湖平均1.86，季节变化不大。
钠和钾离子(Na+、K+)，(单位：毫克当量升/-ME/I)：全湖平均含量3.25，占阳离子总量的46.77%。其中，上级湖平均3.40，下级湖平均3.05。季节变化较明显，在污水入湖口处，平均含量超过4.00。
微山湖水含的主要营养元素(单位：毫克/升)有：
氨氮：全湖平均含量0.371。其中，上级湖平均0.381，下级湖平均0.360。全湖以郗山湾测点含量最高，为0.957。
硝酸氮：全湖平均0.069。其中，上级湖平均0.093，下级湖平均0.036。全年以秋季最高，平均0.222。春季最低，平均0.003，夏季0.006，冬季0.033。
亚硝酸氮：全湖平均0.025。其中，上级湖平均0.005，下级湖平均0.051。
以上“三态氮”，全湖平均0.465。季节变化较明显。
总氮：全湖明水区平均0.825。全年以夏季最高，平均1.46，冬季最低，平均0.398。
磷酸盐：调查测定为0～0.112。全湖平均0.033。其中，平均值最高点为0.059，最低点为0.016。全年以春季较高，秋季最低。其变化与水生植物生长状况、浮游植物生物量和蓄水量均有关系。
总磷：全湖平均0.018。其中，最高值0.038，最低值0.014。
硅酸盐：全湖含量丰富，平均值6.32。其中，上级湖6.02，下级湖6.71。季节变化明显。
总铁：全湖年平均0.092。其中，上级湖平均0.104，下级湖平均0.079。湖心区含铁量较高，水草区较低。全年以冬季含量最低，夏季含量最高。
第四节 水质
1983年，南四湖资源调查协作组，在全湖设马口西南、独山南、仲浅西、南阳西、郗山湾、龟山北、韩庄五段之间、微山岛南和洙赵新河、东鱼河、万福河、十字河河口、微山造纸厂航道河口等25个(上级湖15个，余在下级湖)站点，分4次(1983年4月29日～5月2日；7月11日～14日，9月24日～26日；11月27日～29日)采取水样，观测化验水体的物理性状和化学因子。其结果是：
透明度：湖心明水区水色低，透明度高。其次是水草区。在有明显污水的入湖河口处，水色高，透明度低。透明度的变化范围为0.22～2.85(见湖底)，全年全湖平均值为0.92米。上级湖平均1.04米，下级湖平均0.77米。
含盐量(单位：毫克/升-MG/1)：秋季雨量充沛，湖水位高，含盐量最低，平均值为422；夏季高温少雨，水位下降，含盐量高，平均值为526，全年平均484。随着工业污水的排入，有逐渐增加的趋势。
pH值：据测定在7.1～9.7之间，基本符合淡水渔业用水pH值6.5～8.5的指标要求。pH值的季节变化大，全湖4次25个采样点的平均值为7.6～9.3。其中，上级湖平均7.9，下级湖平均7.6。但各点间差异很大，以吕蒙、山头之间的主航道最高，达9.7。南阳西的居民生活区最低，仅7.1。
溶解氧(单位：毫克/升-MG/1)：全湖平均8.71。其中，上级湖9.01，下级湖7.94。凡有工业污水入湖的河口，较全湖平均值低2～3。溶解氧季节变化较明显，盛夏7月含量最低，入冬前11月含量最高。
耗氧量(单位：毫克/升-MG/1)：全湖平均3.85，夏季最高，平均5.81；春季最低，平均2.5；秋冬平均值分别为4.7、2.7，季节变化较明显。
总碱度(单位：毫克当量/升-MG/1)：全湖总碱度2.36～4.23，平均3.06。其中，上级湖平均3.16，下级湖平均2.93。季节变化以秋季最低，平均2.73，枯水季节最高，年均3.39。
总硬度(德国度)：全湖平均值10.4度，有废水污染的河口硬度偏高，全年以秋季最低，春季最高。
碳酸根离子(CO3--)，(单位：毫克当量/升-ME/I)：全湖平均0.20，占阴离子总量的2.87%。其中上级湖平均0.15，下级湖平均0.27。春季含量较低，夏季含量较高。
碳酸氢根离子(HCO3--)，(单位：毫克当量/升-ME/I)：全湖平均2.86，占阴离子总量的41.11%。其中，上级湖平均3.92，下级湖平均2.66，季节变化不大。但在有工业废水入湖河口处，含量高于其他采样点。
硫酸根离子(SO4--)，(单位：毫克当量/升-ME/I)：全湖平均1.92，占阴离子总量的27.62%。其中，上级湖平均2.03，下级湖平均1.78，湖水污染处含量较高。全年以秋季最低，平均1.63；夏季最高，平均2.3。
氯离子(CI-)，(单位：毫克当量/升-ME/I)：全湖平均1.97，占阴离子总量的28.38%。其中，上级湖平均2.08，下级湖平均1.84。居民生活区高于其他水域，季节变化较明显。
钙离子(Ca++),(单位：毫克当量/升-ME/I)：全湖平均1.67，占阴离子总量的24.01%。其中，上级湖平均1.69，下级湖平均1.64。全年以夏秋两季含量较低，春季较高。
镁离子(MG+±)，(单位：毫克当量/升-ME/I)：全湖平均2.04，占阳离子总量的29.22%。其中，上级湖平均2.17，下级湖平均1.86，季节变化不大。
钠和钾离子(Na+、K+)，(单位：毫克当量升/-ME/I)：全湖平均含量3.25，占阳离子总量的46.77%。其中，上级湖平均3.40，下级湖平均3.05。季节变化较明显，在污水入湖口处，平均含量超过4.00。
微山湖水含的主要营养元素(单位：毫克/升)有：
氨氮：全湖平均含量0.371。其中，上级湖平均0.381，下级湖平均0.360。全湖以郗山湾测点含量最高，为0.957。
硝酸氮：全湖平均0.069。其中，上级湖平均0.093，下级湖平均0.036。全年以秋季最高，平均0.222。春季最低，平均0.003，夏季0.006，冬季0.033。
亚硝酸氮：全湖平均0.025。其中，上级湖平均0.005，下级湖平均0.051。
以上“三态氮”，全湖平均0.465。季节变化较明显。
总氮：全湖明水区平均0.825。全年以夏季最高，平均1.46，冬季最低，平均0.398。
磷酸盐：调查测定为0～0.112。全湖平均0.033。其中，平均值最高点为0.059，最低点为0.016。全年以春季较高，秋季最低。其变化与水生植物生长状况、浮游植物生物量和蓄水量均有关系。
总磷：全湖平均0.018。其中，最高值0.038，最低值0.014。
硅酸盐：全湖含量丰富，平均值6.32。其中，上级湖6.02，下级湖6.71。季节变化明显。
总铁：全湖年平均0.092。其中，上级湖平均0.104，下级湖平均0.079。湖心区含铁量较高，水草区较低。全年以冬季含量最低，夏季含量最高。